到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查变得更加坎坷而且扑朔迷离。另外一重大发展则是史考莉发现自己患有癌症，住院治疗，病情虽稳定住，但仍有危险。本季也介绍癌人的年轻时代，向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命绝望，因而举枪自杀。
故事发生在军阀割据的二十世纪二十年代。为了破获首富郭老爷家丢失的古籍《二十四孝》的案子，江南某县城警察局警探陈九斤联合郭家大公子郭盖、线人万小宝等人，抽丝剥茧，循着《二十四孝》的线索，寻找到当年受嘉奖的二十四位孝子后人，积齐二十四块孝子牌后，终于找到了郭居敬等人所藏、用于弘扬中华孝道之宝藏。故事以寻宝人的亲情、爱情为主线，穿插《二十四孝》原文故事，配合二十四位孝子后人的人生际遇来警示世人，阐释了孝乃立人之本这个道理。
该剧通过钟军以及信访干部陶然、马长乐、胡大壮和吴晴晴等一组人物群像，透过妥善处理与民营企业家齐东的房地产公司超期违建案件，化解沈静跳楼案、老董索要 赔偿案、陈欣与学校的教育纠纷案、林芳丈夫冤死案、兰玥植物人医疗纠纷案和江东市环保垃圾处理厂污染案以及吴川老兵的视角，充分展示了以钟军为代表的新时 期信访干部良好的精神境界和时代风貌，面对上访人的冤屈和疾苦，打骂和侮辱，感激和泪水，面对家人的责难和误解，他们始终保持着冷静而客观的态度，始终坚 持“百姓的事无小事，百姓的事比天大”的理念，勤勤恳恳办实事、任劳任怨解民忧。
