到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查变得更加坎坷而且扑朔迷离。另外一重大发展则是史考莉发现自己患有癌症，住院治疗，病情虽稳定住，但仍有危险。本季也介绍癌人的年轻时代，向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命绝望，因而举枪自杀。
观众可以一睹迪士尼全球目的地（包括华特迪士尼世界、迪士尼乐园、www.inpian.com 和迪士尼邮轮）举办的梦幻婚礼和独一无二的订婚仪式的幕后花絮。从时尚产品到世界一流的娱乐和装饰，观众可以一睹迪士尼“童话婚礼”品牌 25 年来倾力打造的现代童话故事。
在第一季结尾中，Jaha自愿留在太空中，换来方舟部分人成功降落到地球上的好消息。但百子们却在成功引爆驻地打败地表人后，被抓到气象山的隔离区中……Bellamy和Finn也在与地表人的打斗中生死未卜。而这一季的故事就从气象山、原方舟人和其他地球人种展开来。
手机屏幕里，一朵不断旋转的曼陀罗花，引发了连续的跳楼血案。每个跳楼身亡的死者生前，嘴里都会复述两句同样的诗词，而在死亡之后，身体内的器官却会再次丢失。可这所有的案件，南江市刑警队却不予立案，因为根据法医郑罗的尸检结果，死因都是自杀！一个对刑侦破案永远都有自己独特见解的青年小刑警肖建提出，这是一桩有预谋的连环杀人案件，但是肖建没有证据，而且所有人都认为他所做的一切只是在为自己的懦弱做辩解。因为他的师傅“老坛子肉”就是因为调查这个案件时，被他砍断绳索，最后掉入江中被大水冲走。不管刑警队的其他人是否认同，肖建还是独自调查，跳楼自杀案还在南江市继续发生，肖建执意追查到底。 一桩桩案件在肖建的调查下，呈现出了千丝万缕的联系，更让人匪夷所思的是，随着调查的深入，他身边的人居然一个个都变成了嫌疑对象，调查到最后，肖建觉得这个带着面具的杀人狂魔，很有可能就是自己苦寻多日的师傅——“老坛子肉”。
她以为自己是最幸福的女人，却不知她只是被狩猎的猎物...
