到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查变得更加坎坷而且扑朔迷离。另外一重大发展则是史考莉发现自己患有癌症，住院治疗，病情虽稳定住，但仍有危险。本季也介绍癌人的年轻时代，向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命绝望，因而举枪自杀。
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故事发生在北方小城南石市，为了维护法律正义，公安局廖芳华将以薛风、萧琳、鲇鱼头、王泉为首的犯罪团伙抓进了监狱，临近公审，薛风却在转移监舍时被刺，鲇鱼头在越狱时被触电，只有萧琳因为怀孕不适合羁押，不得不放出去监视居住。萧琳为了掩盖自己的罪行，表面装得遵纪守法，暗地里却指使手下黄平安打捞王泉，获取掌握在王泉手里装有自己和薛风犯罪证据的一个优盘，并企图在廖芳华儿子身上下手，搞垮廖芳华的意志，为自己争取时间，达到逃脱法网的目的。廖芳华率领干警层层剥笋，紧紧抓住萧琳犯罪集团内部矛盾，为寻求自保留下的证据线索，排除一个又一个障碍。薛风的秘书张云为求自保，刺杀了萧琳，就在她企图夺回优盘并销毁时，被廖芳华一举
该剧为《开始推理吧》综艺衍生剧古装悬疑探案网剧，讲述了被冤枉为“徐氏灭门惨案”凶手的主人公在多年后深陷幸存者的复仇圈套，成功说服其共同对抗真凶，并找出真相的故事。整个故事发生在一个荒山客栈，众人斗智斗勇，一步步揭开每个人的秘密，还原案件本来面目……
因人类的疏忽与过度索取，那个曾孕育幸福、空气与生命的家园崩塌了。宁静与安宁消散殆尽，取而代之的是阴霾与空气污染——这颗星球已不再适合人类与动物生存。然而，不幸中的万幸是，仍有一处孤存之地保有生机，那里空间充裕，足以容纳人类与动物的栖居。四名男子——Iron、Copper、Marduk与Taiyo——在陌生的环境中苏醒。此地毫无现代痕迹，也不见科技踪影。记忆被重置的他们，必须在这片新世界摸索求生。其间，Copper对Marduk暗生情愫，而这份情感亦得到回应；但Iron的存在，却为这段萌芽中的关系埋下了紧张的种子。
