到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查变得更加坎坷而且扑朔迷离。另外一重大发展则是史考莉发现自己患有癌症，住院治疗，病情虽稳定住，但仍有危险。本季也介绍癌人的年轻时代，向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命绝望，因而举枪自杀。
亲眼见到母亲身亡的许念因PTSD变成哑巴，失去母亲的爱护，父亲又将情人娶进家门，...
凯蒂·福尔曼和雷德·福尔曼的孙女莉亚决定在威斯康辛过暑假，于是这对老夫妇的地下室迎来了一群新世代的少男少女。
当好家伙看到马洛里陷害了一个无辜的人时，他转向布朗神父的帮助。
清纯校园女主or高冷教师？这大概就是青春时期理想中的自己吧！
赫连铮（代高政 饰）深爱继妹何安然（胡亦瑶 饰），却目睹何父囚禁母亲致死。五年后赫连铮以督军身份回归，他抓捕继父强娶继妹为母亲复仇。陌雨棠（管栎 饰）儿时与赫连铮相依为命，却因赫连铮而瘸了一条腿，多年后重聚，陌雨棠绝美戏妆之后却藏着刺骨恨意……
