咖宝指挥官田小咖迎来了像水晶一样灵巧又聪明的水晶咖宝伙伴，同时，升级水晶能量的老咖宝伙伴也再次登场。动物们的安全受到盗猎者、黑心摄影师、非法活动策划者、走私团伙等坏人的威胁，自然环境也因为人类的种种不当行为而受到破坏，捣蛋家族和黑心外星人利用各种手段作恶，城市里还发生着各种各样的危机，小咖和咖宝凭着仁爱和正义的精神，利用勇气、策略和神奇力量，一次又一次战胜困难，消除危机，大家齐心协力，一起帮助动物、大自然和更多的人，持续为身边的世界传播正能量。
故事发生在名为霜科的高级中学里，有川姬（桑原由气 配音）是高中二年级的学生，他虽为男儿身，但生得娇俏可爱，因此常常被不明真相的群众误解。某日，有川姬遇见了纠缠不休的变态，不仅盗摄，甚至向外出售他的照片，就在有川姬焦头烂额之际，霜科高中学生会出现了。就这样，有川姬加入了只有女孩子才能够加入的学生会，并且被规定只能穿女装出席。个性大大咧咧常常惹是生非的副会长步18禁（摩天楼由香 配音）、运动学业全能却很胆小的会长运子（小野早稀 配音）、毒舌中二的书记爱尔威尔缇娜2世（东城日沙子 配音），在这些“怪奇”少女们的围绕下，有川姬会遭遇怎样的命运呢？
皇缠（诹访彩花 配音）是一名平凡的初中二年级女生，从小就离开了父母，和祖父母过着相依为命的生活，皇缠因此格外渴望亲情，也渴望着看似一成不变但实际上充满了小确幸的平静生活。草薙由麻（大空直美 配音）是皇缠的好友，同时也是身上流淌着巫女血脉的巫女候补，肩上背负着沉重的责任。某一日，两人在前往神社的路上遭遇了一连串的意外，一个行踪诡异的男人成为了危害小镇宁静的不安定因素，为了压制疯狂的男人，由麻进行了“神悬仪式”，然而，让所有人都没有想到的是，被神明附身而拥有了能够降妖除魔的能力的人，却是皇缠。
一夜间惨变孤儿的张小凡被青云门收为弟子，经过五年刻苦修炼，他在师门七脉会武上大放异彩，后被派往空桑山打探魔教行迹，旅程中，他与师姐陆雪琪遭遇危难，并结识救护了魔教女子碧瑶，同时，新的危险也在前方等待着他。
