继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
四百年前，现代文明崩溃，如今的世界陷入刀剑与魔法交锋争权的混乱局面。黑暗叛军矢言要让破坏之神安瑟勒萨克斯起死回生。他们在实力惊人的四天王率领下持续开疆拓土，意欲掌控全世界。位于中央金属大陆的梅塔里卡纳王国惨遭魔法师带领的黑暗叛军攻击。为了拯救王国，大祭司的女儿提亚·诺特·洋子必须做出一项决定：将封印在儿时好友吕西安·仁忍体内，曾图谋掌控全世界的古代大巫师复活。而解开封印唯一的办法，就是献上处女之吻。危险迫在眉睫，洋子吻上吕西安的唇。就在这一刻，空气中顿时出现一股惊人的黑暗力量。最强大、最疯狂、最艳色逼人的传奇巫师暗黑施奈德就此复活！
