这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
不死少年陆沉身陷混沌域绝地百万年，只能依托庞大魂力以神识游历诸天万界，但每次游历之后都会陷入长久的沉睡中。历经无数年的暗中布局，改变命数轮回，终于在又一次苏醒后，于神魔墓园脱困而出，如龙入海。时过境迁，昔日被迫收下的徒弟竟成了修为通天的大帝，好心收养的小女孩已成为镇压一界的仙子，就连随手捡的一只癞皮狗，也已成为一宗之祖……诸天万界，天地为局，众生为子，对抗十二苍天，一切都在他谋划百万载的旷世奇局之中
仙帝赵英雄苦修数千年，卡在仙帝境无法破碎虚空。八万年未激活的最强修真系统突然上线，首个任务竟是抽八万年前欺辱他的气运之子张三屁股九九八十一下，奖励为破境关键 “鸿蒙道韵”。赵英雄回归青云宗，发现张三已成美艳失忆的宗门祖师，宗门衰败仅剩三女弟子，还遭嗜血门围攻。他覆灭嗜血门后完成任务，张三晋级金丹，自己也获鸿蒙道韵。系统坑人不断：猎捕活物不说明规则、发筑基体验卡坑他变筑基期，引来血冥渊、天机老人追杀。赵英雄靠仙帝智慧忽悠弟子、拖延时间，待神兽归来恢复实力反杀天机老人，收编鸿蒙仙府、天剑圣地，将青云宗打造成青云仙门。随着鸿蒙道韵增多，他发现重生、系统迟到、宗门衰败，皆源于八万年天道棋局，博弈才刚开启。
1500年前，六耳猕猴反抗如来被镇压。1500年后，无天将他破封释放，召集杨戬、哪吒等东方旧神，一路向东征伐。他们不求经，只夺回被西方神系殖民的秩序权。从东瀛到太平洋，他们砸碎赛博神明、解救四海龙王、唤醒被奴役的土著神族。最终发现西方神已被高维寄生，陷入疯狂自毁。四人联手杀入冥府，在地狱之门前，为砸碎一切压迫而战。
混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化……与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
