《本草中国》第二季延续以“本草”为核心要素，讲述的是本草的功能和用法。相对于第一季对本草药采摘、炮制、配伍的环节和流程展示外，第二季把“用药”作为故事的核心，通过本草把医生与患者的故事串联起来，呈现了四十余位以悬壶济世为己任的国医大师与中医药名老专家，展现他们令人叹为观止的医技和关乎生命的感人故事，充分彰显“大医精诚”的力量，渗透属于中国人的生命观、价值观和自然观。在独特的中国传统文化视角下，用传统中医药哲学“天、地、人”的思想统领全片，从而理解中医药中相互交织相互影响的伟大哲学命题内核。
失踪八年的刘子光（陈伟霆 饰）突然出现在故乡江北市，丧失记忆的他却发现自己有了异于常人的体魄和能力。在一次营救被劫儿童的事件中，被女警胡蓉（马思纯 饰）当成嫌疑人物盯上。江北警方追查新型毒品“天使”跨国大案，机缘巧合下，一腔热血的刘子光协助胡蓉和警方将聂万峰（刘奕君 饰）及相关毒枭一一揪出，却意外发现自己牵涉其中，且与聂万峰渊源颇深。胡蓉的亲生父亲在执行卧底任务时被杀害，也和刘子光脱不了关系。遗失的八年究竟发生了什么，让刘子光的人生彻底颠覆？相处中互生情愫的刘子光和胡蓉，两人将会何去何从？
随着MPU搬入新办公室，新任主管霍利斯·布劳恩督察也随之上任，此时接到报警电话，称一辆载满学生的城市巴士在校外旅行中失踪。小组利用一位曾试图阻止绑架的父亲的线索展开调查，同时杰森也联系了一位老同事寻求帮助。
Alec Mercer是一位世界知名的行为科学家，他以其独特和出人意料的方式理解人类行为，为涉及政府、执法部门和企业的一系列高风险案件提供专业知识。
中原野战军奉命南下，准备参加渡江作战。这时，隐藏、逃窜在豫西南深山密林中的民团残余势力、土匪得到消息后相互串联，钻出深山抢粮食，烧房子，攻打县政府和区政府，直接威胁到豫西南新生政权的稳固。解放军一七三师独立团接到上级命令，立即回师豫西地区，迎头痛击疯狂作乱的土匪武装，一百多股土匪大部分被消灭，剩余的土匪又重新钻进了深山老林，逃之夭夭。独立团团长杨振武在当地政府的配合下，成立了剿匪指挥部。
方展丞（王传一 饰）在即将与未婚妻梁洛涵（任容萱 饰）携手步入婚姻殿堂的这个节骨眼上发生了意外，导致梁洛涵一睡不醒，方展丞自己也双眼受伤。某日，方展丞在巡视柜位的途中意外的听到了梁洛涵的声音，寻着声音找去，出现在方展丞面前的，是名叫陈禹希（任容萱 饰）的女孩。陈禹希收到了百货集团合伙人沈威廉（威廉 饰）的邀请，成为了方展丞的私人看护，因为陈禹希的弟弟身患重病，急需巨额的医疗费，所以这对于她来说是一份不可多得的好工作。然而，让陈禹希没有想到的是，原来方展丞竟然就是自己之前偶遇的那个“偷窥狂”，两人之间的关系就这样以一场误会的形式开始了。
