《本草中国》第二季延续以“本草”为核心要素，讲述的是本草的功能和用法。相对于第一季对本草药采摘、炮制、配伍的环节和流程展示外，第二季把“用药”作为故事的核心，通过本草把医生与患者的故事串联起来，呈现了四十余位以悬壶济世为己任的国医大师与中医药名老专家，展现他们令人叹为观止的医技和关乎生命的感人故事，充分彰显“大医精诚”的力量，渗透属于中国人的生命观、价值观和自然观。在独特的中国传统文化视角下，用传统中医药哲学“天、地、人”的思想统领全片，从而理解中医药中相互交织相互影响的伟大哲学命题内核。
杨初末（金雯昕 饰）是一位天真烂漫个性开朗的少女，幸运的考入了当地最有名的艺术大学星辰音乐学院。在学校里，杨初末偶然邂逅了名为慕流年（方逸伦 饰）的男生，慕流年凭借着高超的琴技，成为了学校里的风云人物。 让杨初末没有想到的是，高高在上的慕流年，竟然就是自己小时候喜欢过的邻家哥哥，杨初末想要用一首钢琴曲来唤起慕流年对自己的回忆，哪知道糟糕的演奏让慕流年对她敬而远之。学校里举办了一届音乐比赛，获胜的选手能够获得高额的奖金，杨初末想要和慕流年搭档参加比赛，遭到了后者无情的拒绝。
