变形联盟和海澄合力击败敌人，平溪市再次回归和平。然而时空能量异常波动情况却愈演愈烈，导致现实世界与平行宇宙发生交错产生了时空歧点，时空兽也随之出现。就在变形联盟忙于对付时空兽修复时空歧点时，茜卡与双子星汇合，策划了一系列针对变形联盟和平溪市的侵袭行动，也趁乱夺走沉睡在基地中的虫王卵。阻止时空错乱，抵抗浩肯星侵袭，面对双重压力和危机，变形联盟和海澄毫不退缩。但在一连串的强攻之下众人逐渐失去自我，在海澄的帮助下恢复斗志，最终一起击败强大敌人，守护了时空秩序与地球和平。
本剧讲述超级飞侠继续从全新的超级空间站出发，升级为电能超级飞侠，前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并用升级电力技能帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在哈尔滨冰雪节，他们用高超的电能技能阻止了金小子、金小薇造成的冰雕骚乱；在澳大利亚的伍伦贡，他们通过时空旅行穿梭到恐龙时代，和翼手龙宝宝一起练习飞行；尽管困难不断，但电能超级飞侠会用炫酷的新技能、新装备，继续圆满地解决问题。
在即将坠入深洲的危急关头，辛灵被“神秘人”救出，意外来到了荒石被封印的地方。而荒石却在战斗中身受重伤，元神消散。为了救回荒石，叶罗丽战士们也行动起来，前往奇幻的仙境，开启全新的冒险之旅。在拯救荒石的过程中，辛灵带领孩子一起怀揣勇气与希望，再度探寻爱与成长的真谛。
