变形联盟和海澄合力击败敌人,平溪市再次回归和平。然而时空能量异常波动情况却愈演愈烈,导致现实世界与平行宇宙发生交错产生了时空歧点,时空兽也随之出现。就在变形联盟忙于对付时空兽修复时空歧点时,茜卡与双子星汇合,策划了一系列针对变形联盟和平溪市的侵袭行动,也趁乱夺走沉睡在基地中的虫王卵。阻止时空错乱,抵抗浩肯星侵袭,面对双重压力和危机,变形联盟和海澄毫不退缩。但在一连串的强攻之下众人逐渐失去自我,在海澄的帮助下恢复斗志,最终一起击败强大敌人,守护了时空秩序与地球和平。
本剧讲述超级飞侠继续从全新的超级空间站出发,升级为电能超级飞侠,前往世界各地旅行,在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友,并用升级电力技能帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在哈尔滨冰雪节,他们用高超的电能技能阻止了金小子、金小薇造成的冰雕骚乱;在澳大利亚的伍伦贡,他们通过时空旅行穿梭到恐龙时代,和翼手龙宝宝一起练习飞行;尽管困难不断,但电能超级飞侠会用炫酷的新技能、新装备,继续圆满地解决问题。
在即将坠入深洲的危急关头,辛灵被“神秘人”救出,意外来到了荒石被封印的地方。而荒石却在战斗中身受重伤,元神消散。为了救回荒石,叶罗丽战士们也行动起来,前往奇幻的仙境,开启全新的冒险之旅。在拯救荒石的过程中,辛灵带领孩子一起怀揣勇气与希望,再度探寻爱与成长的真谛。