当一个在乔治亚州度假的家庭在他们的汽车旅馆被杀时，小组被带去调查。他们了解到ATF也参与其中，因为他们怀疑这一家人到乔治亚州是为了廉价购买枪支，然后带回来卖掉。在与妻子的妹妹交谈后，他们证实了这一点，她也参与了这一计划。他们了解到有一个人跟踪他们，显然是想抢劫他们，但却杀了他们并拿走了他们的枪。巴恩斯重新加入了团队，他对斯科特的风格不是很感冒。斯科特告诉他的妹妹，他们需要把他们的母亲送到护理机构，但她对这个想法并不热衷。
1941年太平洋战争爆发后，一艘中立国瑞士的商船“海狼号”秘密驶进了上海。在这艘商船上，集中了以船长、中共地下党员许伯涛为首的一群爱国青年，其中以大副萧汉光、水手长余龙、电讯员秦坤为骨干。这三人分别渗透到了“军统”和“中统”以及汪伪特工总部的“76号”与日特机关周旋，演绎出一系列惊心动魄的故事。从暗杀“军统”叛徒到护送中共要员进行策反，从三夺乾隆皇帝御封的“龙泉”宝剑到四盗德国纳粹提供给上海日军的轰炸机瞄准仪，从巧送电台到延安到为中国远征军送达最高命令，从破获日特机关在重庆密布的“银狐”间谍网，到护送蒋介石到开罗出席“三巨头”会议，剧情跌宕起伏，险象环生，讴歌了中华民族的浩然正气，书写了中华儿女可歌可泣的壮丽诗篇。
1937年，中华民族进入了最为苦难的一段时期。日寇侵华，血腥的铁蹄踏遍神州，熊熊战火灼烧着祖国每一寸土地。在国难当头的危机时刻，留学多年的数学博士陈家鹄（郭晓冬 饰）携日籍妻子惠子（尹媗 饰）回国，希望奉献自己渺小的光和热。由于他在国外曾对日本的电报密码有所了解，因此陈成了日寇急欲猎杀的目标，也成为国民政府积极网络的对象。经过一番波折，他最终加入国民党军统下辖的密电破译机构“黑室”的一员，虽然憎恨国民党的腐败，但是受制于人的陈仍被迫为黑室工作。在此期间，他和惠子也因身份的特殊屡遭军统刁难。与此同时，我党人员成功打入黑室，为了新中国的建立做着最后的努力……本片根据著名作家麦家的同名小说改编。
