自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
Mark Grayson是个普通青少年，除了一点——他的老爸是这个星球上最强大的超级英雄。在他十七岁生日后不久，Mark开始发展自己的超能力，并接受父亲的指导。他拥有和父亲一样超强的力量、速度、飞翔能力，刀枪不入，老化缓慢，自愈能力强。
每天入夜，当春日部的居民们酣然入睡之后，他们都会来到一个神奇而又美丽的梦中世界中。在那里，他们可以实现一切想要实现的愿望，满足一切渴望满足的要求，这个梦中的世界充满了快乐和幸福。
一年级的远野从东京转入深山里的全寄宿制男子学校“私立郁郁葱葱学园”。坦率地跟他打招呼的矢口，成为了他唯一的朋友。因为不擅长打球而加入了最轻松的摄影社，没有加入矢口所在的足...
一个神秘的名叫珠露露（ジュルル）的婴儿突然出现在少女们身边，最先发现她的真中啦啦因为各种原因自然而然地成为了她的母亲，暂时照顾她，升级为“妈妈”。此外，新系列中还将出现一个神秘三人偶像组合。分别是珠音，花音，日音。
