照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难……本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。

这是一部描绘非线型历史的神话故事。人类大战持续了将近50年，世界由此分化为大亚细亚连邦共和国和欧共体两大阵营。持久战结束后，大亚细亚连邦共和国终于取得了胜利，并统治了欧洲和亚洲部分大陆，但战利品并不可观，除了土地的荒废，人心的慌乱外，还残留了很多战争后遗症。比如一些在战场上使用过的杀伤性化学武器、细菌武器、核武器等等。这一情形告诉我们拯救人类、拯救社会、拯救世界刻不容缓，人类处于即将崩溃的状态。怎样去面对这一切？怎样去寻找重生的道路？社会呼唤有志之士勇敢地战出来给这个被战争荒废了世界寻找一个公道。在这样危急的时刻，东博士提倡“完整地制造出人类所有器官的新造细胞”理论，这一理论在学术会上得到了认可。东博士的爱妻绿已久病卧床不起，为了把妻子从死神手中夺回来，东博士也必须完成这个研究。但社会保健部门从研究初期开始就企图独吞这一成果，为了顾全大局东博士在不断让步的情况下，着手开始这项研究。在东博士的呕心沥血的研究下，新造人类终于诞生。但原本是以拯救人类为目的制造的“新造细胞”到头来却于人类为敌，把人类赶进血的世界……

在未来的某一天，一对男女Retro（山口胜平 配音）和Pandy（本田贵子 配音）在一片荒野中醒来，却发现自己不但赤身裸体而且丧失了记忆。二人来到了东京闹市中肆意抢劫衣服和食物，经过一番大战后，两人被捕，并被投放到月球上的监狱“Dead Leaves”。

文殊的和平寺、岛藏、伊乃藏、菊藏、鹤藏五人组成的刺客团在甲州路上秘密追捕座头市，并在座头市乘坐的轿子前刺杀了他。然而，轿子里面却有一个年轻女子，名叫小丰，怀里抱着一个婴儿。途中，一将自己的轿子交给了突然病倒的小丰。当市听到小丰的死讯时，他决定将孩子交给小丰在信州宫本村的丈夫宇之介。盲人阿一抱着孩子，在轿夫童平和马助的陪伴下，开始了照顾孩子的旅程。然而，五人组却向这座城市发起了进攻。五个人中，有一个人被一的居合剑法砍倒了。道平和马助撤退了，一则带着孩子继续赶路。刺客因朋友的死而勃然大怒，与害羞的 Magojo Hangoro 结盟，并在 Ichi 换尿布时袭击了她。然而，即使在那里，阿一的剑也夺走了半五郎家族十名成员的生命。盲人阿一一边照顾孩子，一边成为黑帮成员，旅途充满艰辛。在通过一晚的赌博赚了一些钱之后，第二天醒来，一帮助了一位被乡村武士追赶的女钱包剪贴师冈，并雇用她来照顾他。冈爱上了 Ichi 的精神，尽管他们之间有争吵，但冈还是经常照顾 Ichi。有一天，当 Oka 让她的婴儿在二楼小便时，被路过的相扑选手 Koteushi 抓住了，Oka 和 Ichi 之间发生了争斗。四人恰巧路过此处，向没有带暗剑的阿一发动攻击，不过阿卡凭借敏捷的思维成功逃脱。就在一和冈开始对彼此产生不可分割的爱意时，一去拜访了已成为黑帮老大的卯之介。然而，卯之助却命令手下将抱着婴儿的一赶走。宇之介的态度让一感到愤怒，她把婴儿连同小丰的头发一起托付给了她家庙瑞光院的僧侣。与此同时，在寺庙外面，卯之助的盟友，刺客和平次和他的手下，点燃了竹矛的尖端并袭击了阿一，将他包围并杀死。这就是平次打败一之居合的计划。在火焰和刀刃中，阿一打败了四人和他们的同伙，但只放过了婴儿的父亲卯之介。当 Ichi 和 Oka 与他们的孩子告别时，他们的眼里闪烁着泪光。

堂山和下妻两家老大剑拔弩张，蒙在鼓里的座头市（胜新太郎 饰）被堂山请去助拳，半路斩杀了前来挑衅的下妻家三武士。失去引路人的阿市独自上路，期间营救了遭武士欺侮追杀的江户鸣海屋的小姐美津（藤村志保 饰）。受女孩死去的爷爷所托，阿市决定护送美津返回江户。谁知三武士之一的妻子阿久（藤原礼子 饰）衔恨座头市，想尽各种办法拐走美津。有信有义的阿市拼尽全力保护美津，在这一过程中身份和地位存在巨大差距的二人也渐渐产生好感。清醒认识到和女孩的差距，阿市克制着自己的情感。当旅途渐渐到达终点，一切矛盾都到了爆发的时候……

和往常一样，故事是关于座头市惩罚无良老板的故事，但在大剑战斗的高潮中，一被扔进桶里旋转，他呻吟着，“你瞎了眼睛，然后跳出了桶！”用木桶砍倒敌人的想法很有趣。

突然间，这个世界被分成了四个，景和，妳音，道长，兹穆丽被飞进这四个不同的世界里，而且在这个看起来不一样的世界里，他们遇见了四个怎样看都不对劲的英寿，英寿竟然被分裂成了四个。究其原因是未来人搞的《世界毁灭游戏》，面对英寿和世界的危机，太狸、猫猫、牛牛、狼姐、老爷爷和南瓜熊也参战，在着奇想之外的展开中，黑色的极狐出现了，究竟英寿和世界的命运会如何？

庵野秀明 担任脚本·监督 电影『新 假面骑士』制作决定！！！

座头市无法忘记童年的记忆，急忙前往妙义山观看今年的第一个日出。途中，他偶然收到了一位自称信介的旅行者的信，并将其交给了笠间旅馆武藏屋的女仆阿仙。在那里，一遇见了正在探望失踪父亲的大崎。与此同时，当地老板甚平看到喜剧演员们的进步，要求他们送来40-60次。客栈里的艺人们很生气，但是对于绑在县令和鹿岛身上的两条腿的草吉却没有什么办法。一天晚上，信介回到了武藏屋。信介在大观甚平的命令下杀死了大崎的父亲，大崎的父亲将案件强行提交给江户。然而，他向甚平承诺的自己与县令很熟悉的承诺却遭到了破坏，他在追兵的包围下逃到了一家旅馆。然而，心狠手辣的甚平却重重地砍倒了信介。就连偶然听到这件事的一，也没有勇气向对此一无所知的大崎透露真相。某天，一前往赌场探望甚平，并利用自己的特长居合紫里识破了骗子，并击败了甚平、鹿岛县令等人。然而，在场的鹿岛保镖大木却识破了鹿岛城的杀机。由于担心被甚平盯上的大崎的安全，一向保留着在酒吧遇见的父亲记忆的老人义十提供了帮助。然而，义州因为甚平想要酒而将咲卖给了他。一独自前往检查站营救被困在县令家中的大崎。座头市的致命剑因愤怒而颤抖，击倒了鹿岛、甚平等人，并安全救出了大崎。这是新年的第一天，太阳将城市孤零零的影子涂成红色。

这部电影将由原著漫画作者田畠裕基担任监制，讲述原作中并未透露的魔法帝的故事。在一个魔法主宰万物的世界里，生来就没有魔法的男孩亚斯塔立志成为“魔法帝”，以克服逆境，证明自己的力量，并遵守与朋友们的约定。