《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
仙帝赵英雄苦修数千年，卡在仙帝境无法破碎虚空。八万年未激活的最强修真系统突然上线，首个任务竟是抽八万年前欺辱他的气运之子张三屁股九九八十一下，奖励为破境关键 “鸿蒙道韵”。赵英雄回归青云宗，发现张三已成美艳失忆的宗门祖师，宗门衰败仅剩三女弟子，还遭嗜血门围攻。他覆灭嗜血门后完成任务，张三晋级金丹，自己也获鸿蒙道韵。系统坑人不断：猎捕活物不说明规则、发筑基体验卡坑他变筑基期，引来血冥渊、天机老人追杀。赵英雄靠仙帝智慧忽悠弟子、拖延时间，待神兽归来恢复实力反杀天机老人，收编鸿蒙仙府、天剑圣地，将青云宗打造成青云仙门。随着鸿蒙道韵增多，他发现重生、系统迟到、宗门衰败，皆源于八万年天道棋局，博弈才刚开启。
本季中邪恶的女王曼多拉将孔雀和罗丽抓回仙境，为救出同伴，各位主角将再次闯入仙境。女王控制的仙境更加危险，能否救出同伴我们还将拭目以待。本季中全新角色琪娜将会登场，她拥有神秘娃娃菲灵，并有着独特的战斗技能。她能否击败水王子和封银沙阻止邪恶女王的计划吗？
