康熙12年11月,吴三桂联合耿精忠、尚之信发动了三藩之乱。占领了江南大部,20岁的康熙皇帝,派兵三路应敌,局势相当紧张,而此刻,黄河大水泛滥。安徽巡抚靳辅受命加收救灾捐税,在筹款过程中,歙县知县唐敏,为了讨好上司,不顾百姓死活,催逼勒索,交的节流最多,靳辅对此并不知情,当众表扬了他。唐敏得到巡抚赏识更有恃无恐。而上交款子最少的知县于成龙却不买账,不仅顶撞了靳辅,还挪喻靳辅是个昏官。
十年前,苏家因巫蛊案满门蒙冤,长女苏昭雪侥幸逃生。为寻找失散的妹妹并查清真相,她女扮男装,闯入京城。因缘际会下,她与被卷入案中的御史方济联手,以钦差身份前往晋州探查。两人抽丝剥茧,发现地方官借巫蛊之名贩卖私盐的阴谋,更牵扯出苏家旧案的线索。随着调查深入,幕后黑手也就是当朝国师逐渐浮出水面,其阴谋直指皇权。苏昭雪与方济历经生死,最终在朝堂之上揭露惊天真相,为家族与无数冤魂昭雪,并携手归隐。