坂井悠二的高中生活刚刚开始，本将一直持续的平凡生活却因为一次偶然而发生了剧变。回家途中，商店街的时空突然停止，这封闭空间中所有人的灵魂都被魔物吸去。而手持日本刀与魔物战斗的灼眼红发美少女，告诉了悠二惊人的真相“你已经死了，现在的你只不过是以另一种形态活着。”接受了这个事实的悠二决定与这位灼眼红发美少女一起为世界而战，并以少女的武器名来称呼她为“夏娜”。为了世界的未来，夏娜被卷入了一次又一次的战斗之中，二人的羁绊就此展开。
半田清舟（岛崎信长 配音）身为著名书道家半天清明的儿子，有着一段不同寻常的童年。半田拥有英俊的外表和聪慧的头脑，却偏偏性格内向不善言辞，接二连三的误会让他成为了同学们眼中的“怪咖”，而向来笨口拙舌的半田自然无法替自己正名，就这样，校园中关于“半田之壁”传说不胫而走，总是曲解他人好意的半田该如何翻身？总是戏弄半田的川藤鹰生（兴津和幸 配音）、成绩优异具有领导气质的相泽顺一（广濑裕也 配音）、样貌英俊总与半田较劲的二阶堂礼绪（柿原彻也 配音）、 身强体壮的肌肉男筒井茜（细谷佳正 配音）、和半田境遇相似的近藤幸男（山下大辉 配音），在他们的陪伴和帮助之下，半田最终能否走出心灵的桎梏，获得周遭的认同呢？
万磁王为了争取更多变种人的权利，他聚集了一批部下不断针对人类进行破坏。而X教授致力于人类与变种人之间和谐生存，他创办了X学院，收取变种人学生，教导他们知识，让他们能合理运用自己的能力。培养他们成为X战警，保卫人类与变种人。
那是在极限的世界战斗的人们之间牵绊的物语—— 存在于这一时空的，无数平行世界之一—— 在那里，人类驱使着被称作战术步行战斗机（战术机）的人型兵器，与敌对的地球外起源种「BETA」持续了长达数十年的战斗。被灭亡的危机逼入绝境的人类，在残酷的命运当中将会展现怎样的生存方式——
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小黑跟随师父在小镇上过着安宁日子，分会馆遇袭，打破了妖精世界维系多年的和平，来自妖灵会馆的“全新任务”也让两人陷入分离危机，更让师父无限的处境发生翻天覆地的变化。面对环环相扣的谜团，小黑与师姐鹿野共同开启了寻找真相的新冒险。这一次小黑能否经受住考验，顺利保护师父化险为夷？
