该剧以发明创造为主线，描写嘟嘟宝星球上的两位主要人物：发明狂卡卡嘟和他的随从波波嘟。卡卡嘟会发明任何特别神奇、充满智慧和想象力的东西，但这个东西一旦到了波波嘟手里，总会产生意想不到 的效果，反而让发明者卡卡嘟处境尴尬或狼狈。波波嘟看起来傻乎乎的，但其实他常常是大智若愚的；而卡卡嘟看起来极其聪明，但其实常常又是漏洞百出、弄巧成 拙的。这两个人物本身就是一对矛盾，使故事充满了诙谐和幽默，极富逻辑性和想象力，给人以启迪。
安是一个经常说谎的男孩，某天，他意外地跌入了另一个世界，在试图找回原来的世界时，他遇到了危险，这迫使他转变并逐渐成长，凭借他的富有创意的头脑，他学会了如何帮助他人。在旅途中，他不仅交了很多朋友，还得到了其他人的帮助，他能够在大家的帮助下返回家吗？
怪兽世界的侦探多罗邀请原作主角、怪兽猎人麻衣剑野参加武术大会，以选出下一任怪兽首相。然而，麻衣对此毫无兴趣，因为她从未经历过这样的事。麻衣的妹妹光一直在旁观，于是她介入了。于是多罗奉承光，试图让她以麻衣剑野二号的身份参加武术大会。与此同时，在世界的某个角落，怪兽们正密谋改造一个男孩，控制人类世界……
阿部晴明是一位害羞、爱哭、笨手笨脚的人类老师。
目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑…
