《谁家的孩子》第二季延续第一季的故事，孩子们都长大了一岁，仍然是一群快乐的小学生。急公好义的夏子鹏，调皮捣蛋的邱阳，聪明伶俐的诗琪，古灵精怪的雪灵，还有品学兼优的表哥璨彬。新的学年，他们身边多了一群新的朋友，机灵鬼文辉，小不点天天，新班长小蔓，开心果安安，他们的学习和生活依然是丰富多彩，他们的家长依然是爱恨交加。他们自我的意识在苏醒，开心和烦恼敲打着他们的心窗，身边的世界开始展示出更多更复杂的层面，他们继续享受着快乐的童年，收获着身心的成长，也经历着磕碰和摔打。
故事发生在上世纪三十年代末的江南水乡。民间抗日志士高明远率领的队伍是当地一支著名的抗日力量，在一次劫日军监狱救人行动中，他们偶遇新四军游击队，也遇到了曾经的同学—现任新四军游击队队长的心月。心月欣赏明远的人品和才能，希望明远加入新四军，共同抗日。明远和手下的兄弟们固执地凭借个人的力量对抗日军，险些铸成大错。在心月的帮助下，明远等人认识到自己的鲁莽和任性，幡然悔悟，加入游击队，与心月一起携手作战。虽然开始有些无所适从，但经过努力，大家逐渐适应了部队生活。他们英勇奋战，挫败了日军扫荡计划。明远和他的兄弟们也在战斗中成长，成为真正的革命战士，与此同时，明远和心月也碰撞出了爱情的火花。
陆依依（王姿允 饰）是一个超级理性的女人，生活中的大小事宜全部在计划表之内，每日按部就班的完成，绝对不会发生节外生枝的意外。这样固执而又死板的个性让陆依依至今感情生活一片空白，男人们对她敬而远之。随着年岁的增长，陆依依的父亲开始着急了，为了稳定父亲的情绪，陆依依登录了婚恋网站，决定替自己找一段不需要投入感情的“契约婚姻”。一个名为欧阳宇飞（郭晓冬 饰）的男人出现在了陆依依的视线中，他逢人便称自己是自由撰稿人，实际上却连一篇稿件都没有发表过。而欧阳宇飞征婚的理由，只是不想再留在母亲身边啃老了。这样的两个人一拍即合，开始了他们的“婚姻生活”，很快，一连串的麻烦的问题接踵而至。
