《谁家的孩子》第二季延续第一季的故事，孩子们都长大了一岁，仍然是一群快乐的小学生。急公好义的夏子鹏，调皮捣蛋的邱阳，聪明伶俐的诗琪，古灵精怪的雪灵，还有品学兼优的表哥璨彬。新的学年，他们身边多了一群新的朋友，机灵鬼文辉，小不点天天，新班长小蔓，开心果安安，他们的学习和生活依然是丰富多彩，他们的家长依然是爱恨交加。他们自我的意识在苏醒，开心和烦恼敲打着他们的心窗，身边的世界开始展示出更多更复杂的层面，他们继续享受着快乐的童年，收获着身心的成长，也经历着磕碰和摔打。
改革开放初期，主人公陈晨面对贫穷落后的家乡，立志大力发展经济、改变乡村面貌。她放弃了自己在福海市建委的工作，回到三江村担任村支书，与村里的林威龙、陈采薇、林祖望等年轻人一起整顿村容村貌、筹建工厂。在这个过程中，陈晨遇到了传统观念的阻力，也面临着征地、招商引资等等复杂而艰巨的挑战。陈晨等基层干部带领群众坚定地朝着福海市委市政府指定的“3820”发展战略方向前进，兴建兴民经济开发区、打造闽江引水工程、修建星海码头、三江港。在干部群众的努力拼搏下，三江县实现了“从田野走向世界”，福海市也发生了巨大变化。
故事发生在上世纪七十年代初期。上山下乡运动如火如荼，庄会生（史天庚 饰）因暗恋叶晓帆（王媛可 饰），偷改志愿，结果事与愿违，独自去了陕北，而叶晓帆、乔海洋（张译 饰）等人则分配到东北建设兵团。纨绔子弟段军对叶一见倾心，但叶只对海洋有好感。范学东（刘向京 饰）心胸狭窄，一次次给开朗乐观的海洋下套，但都被大嘴连长（程煜 饰）解围。刘北上（王桂峰 饰）与海洋亲如兄弟，他喜欢上郑红梅（沈傲君 饰），而红梅暗恋的却是乔海洋。叶晓帆对段军的骚忧防不胜防，为此海洋与他大打出手，但最终晓帆还是落入段军设下的圈套，被其强奸致孕，自杀时被招工回城的庄会生救下，闻讯后的乔海洋彻底绝望......
第四季一开篇，Tommy Gavin一如既往地陷入麻烦之中。Sheila要求他从FDNY退休，跟她一起去海边，在那栋她用911遗孀抚恤金买的豪宅中享受二人世界，但Tommy拒绝了。恼羞成怒的Sheila对Tommy下了迷奸药，然后放火把房子夷为平地。醒来后的Tommy记不清当时的状况，再加上他的暴力、酗酒、酒后短暂失忆等前科，使得保险公司将他作为纵火嫌疑犯进行调查。一时间，关于Tommy的流言蜚语遍布了FDNY，甚至惊动了FDNY的高层，他们决定从内部调查Tommy。Tommy的饭碗和人身自由都处于不保的境地。
落难的李奇（罗嘉良 饰）在穷途末路时遇到了小学同学谢源（吴镇宇 饰），谢源误以为李奇轻生要跳海而出手相救，李奇便自此留在了谢源家中。刚好的邻居冯仁昆（黎彼得 饰）介绍他们到片场当临时演员，也认识了当红的影星邵芳芳（宣萱 饰）、程宝珠（张可颐 饰），四人更从欢喜冤家变成了恩爱无比的恋人，一起面临了不少人生关卡……
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