宇宙世纪0071。卡斯瓦尔和阿尔蒂西亚失去了父亲吉恩·祖姆·戴昆（Side 3 Munzo 自治共和国的主席），与父亲的亲密助手金巴·拉尔一起逃离了 Side 3。在地球上，他们以爱德华·马斯和赛拉·马斯的名字生活。与此同时，Side 3更名为吉翁自治共和国，副议长德格文·索多·扎比领导的扎比家族控制了国家。扎比家族已经追上了卡斯瓦尔和阿尔蒂西亚，并开始开发一种新武器“机动工人”，目标是地球联邦军。
幽冥殿之主，龙国最强人物夜修罗：贺云霆，机缘巧合之下重回故土云州。在所有人都以为他还只是贺家弃子、林家废婿时，他早已隐忍布局好了一切。亡母之恨、凌辱之仇，他发誓要寻回一个公道，势必要让所有迫害他的人血债血偿。
故事发生在1924年的圣瓦尔贵族子弟寄宿学校玛格丽特学院，转学生久城一弥（江口拓也 配音）刚刚来到学校，就因外表而被称为不详的“黑色死神”。实际上，一弥是个老实又木讷的男孩，可正是这样的性格使他总是轻易的会被卷入难以用常理来解释的怪奇事件中。在一次杀人事件中，一弥遇见了身材娇小一头金发的少女维多利加（悠木碧 配音），这个谜一样的少女以其高超的智商帮助一弥脱出了险境，两人的羁绊也从此开始了。在这个校园里，流传着许许多多耸人听闻的灵异事件，而在这些事件的背后，作祟的究竟是鬼怪还是人类，这个问题的答案就要交给一弥和维多利加去一一破解了。
