宇宙世纪0071。卡斯瓦尔和阿尔蒂西亚失去了父亲吉恩·祖姆·戴昆（Side 3 Munzo 自治共和国的主席），与父亲的亲密助手金巴·拉尔一起逃离了 Side 3。在地球上，他们以爱德华·马斯和赛拉·马斯的名字生活。与此同时，Side 3更名为吉翁自治共和国，副议长德格文·索多·扎比领导的扎比家族控制了国家。扎比家族已经追上了卡斯瓦尔和阿尔蒂西亚，并开始开发一种新武器“机动工人”，目标是地球联邦军。
小蜜蜂每天都和小昆虫们快快乐乐的玩耍着，和疼爱他的哈妮妈妈过着幸福的生活。因救了小蚂蚁，而认识的甲虫爷爷来到他家做客，小蜜蜂不经意间知道了自己的身世，原来他不并不是哈妮妈妈亲生骨肉。他刚出生时，蜜蜂王国因遭到大黄蜂的袭击，蜜蜂家族全军覆没。哈妮妈妈受女王的嘱托带着小蜜蜂逃了出来。现在知道他的亲生妈妈蜜蜂女王还活着，于是为了重新振兴蜜蜂王国小蜜蜂踏上了寻找妈妈的征程。小蜜蜂在寻找妈妈的路上还帮助了许多遇到困难的昆虫们。他虽然和同样在寻找自己的妈妈擦肩而过，但谁都没有发现彼此。小蜜蜂到底要经历多么艰辛的旅程，才能和妈妈重逢呢？
纱名（大和田仁美 配音）自幼生活在“研究所”中，从未涉足过外面的世界。她拥有能够任意改变周遭物体的超级能力，因此被当做“危险品”一般受到重重监护。某日，再也忍无可忍的纱名逃出了研究所，随即遭到了组织的追捕。无处可去的纱名在走投无路的境遇下遇见了名为㭴村藏六（大冢明夫 配音）的老者，善良的老人收留了纱名。藏六和孙女早苗（丰崎爱生 配音）过着相依为命的生活，如今家中多了一个女孩，生活倏地热闹起来。和纱名一起逃出来的，还有个性大大咧咧自由奔放的雏雾朝日（藤原夏海 配音）和她的双胞胎妹妹雏雾夜长（鬼头明里 配音），女孩们所要面对的，是步步紧逼的研究员以及她们扑朔迷离的身世。
一个在宠物店工作的女孩，拥有与动物说话的能力。
叶家废柴少主叶凡丹田被废，受尽屈辱，在遍尝人间冷暖以后，获得了虚假的记忆与强大的力量，仍坚守本心，最终踏上拯救苍生的旅途。
某一天的相遇为开端，通过Cosplay加深交流的喜多川海梦与五条新菜。还有好多想尝试的Cosplay，想制作的服装。在与同班同学们的交流，以及新的Cosplay伙伴们的相遇中，海梦与新菜的世界变得更加广阔。然后，对新菜怦然心动、心跳不已的海梦的恋情会有进展吗――！？因Cosplay而拓展的世界，找到的自我――海梦与新菜的Cosplay心跳♡爱情故事，继续上演！
[TV动画] 明日方舟 [RISE FROM EMBER] 制作确认！博士，很高兴再次见到你。
