飞机上的一个乘客突然变得癫狂，又遭遇到飞机强气流，待一切平稳下来，这名乘客已经突发性脑水肿死亡。而这名乘客身份并不普通。他是某保姆单位的高级研究人员，因涉嫌向外间谍组织出卖国家情报而遭到了有关部门的监控。他的离奇死亡使得这场监控和追捕遭到了停滞。而这时，国安局逮住了死者的弟弟王浩。于是想出一计，让侦查员沈亢（孙红雷 饰）扮成王浩，进而引蛇出洞。而这场卧底追捕，与王浩的中间联系人就是飞机上的空姐李小晚（傅晶 饰）。二人在一来二往中，互生情愫。但无奈卧底的身份不得暴露，小晚则纠结王浩黑社会的身份。
故事发生在上世纪七十年代初期。上山下乡运动如火如荼，庄会生（史天庚 饰）因暗恋叶晓帆（王媛可 饰），偷改志愿，结果事与愿违，独自去了陕北，而叶晓帆、乔海洋（张译 饰）等人则分配到东北建设兵团。纨绔子弟段军对叶一见倾心，但叶只对海洋有好感。范学东（刘向京 饰）心胸狭窄，一次次给开朗乐观的海洋下套，但都被大嘴连长（程煜 饰）解围。刘北上（王桂峰 饰）与海洋亲如兄弟，他喜欢上郑红梅（沈傲君 饰），而红梅暗恋的却是乔海洋。叶晓帆对段军的骚忧防不胜防，为此海洋与他大打出手，但最终晓帆还是落入段军设下的圈套，被其强奸致孕，自杀时被招工回城的庄会生救下，闻讯后的乔海洋彻底绝望......
第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。
一九七二年，青年工人张永康（冯远征 饰）正式成为云锦织造的一员，内心充满期待。为了向心爱的姑娘苏慰（何琳 饰）慈表达爱意，他计划了一个别致的婚礼，然而这一切却被他的竞争对手邹狄克无情打破。随着邹狄克的介入，几位青年男女陷入了尴尬而复杂的感情纠葛。二丫对张永康情有独钟，固执地想要得到他的爱，而纯洁坚贞的苏慰慈则不愿放弃自己的初恋。命运在此时却发生了巨大的转折：苏慰慈的神秘背景被曝光，她竟然是一个“汉奸”的女儿。为了保护张永康，她忍痛割舍自己的初恋，违心地嫁给了邹狄克。此时，二丫终于看到了与张永康在一起的希望。然而，命运又一次捉弄了他们。邹狄克意外有了孩子，这一消息使苏慰慈进退两难，她不得不面对婚姻的复杂性。二丫也逐渐意识到，张永康心中仍有苏慰慈的身影，痛苦的她决定放弃这段感情。在经历了一番挣扎后，苏慰慈最终选择远走日本，试图忘记这一切。十几年后，苏慰...
