在电影FTF里出现的变种alien从一个基因技术研究公司的员工肚子里钻出来逃跑了。Mulder和Scully找到了Gibson，他带Mulder去找那个alien。Scully证明出Gibson可能是外星人（所有人类都可能是）。X档案现在由Spender和Fowley主管。Gibson最后又不见了。
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第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。
互动爱情喜剧，围绕土星特派员土帅和火星王子火种对地球女孩陆凡的“爱情争夺”，并与生活在地球的其他外星人展开了一系列嘀笑皆非、浪漫搞笑的日常故事。 观众可在每集自由点选互动选项来决定主角的命运和剧情走向。
孤儿周梓易和合租女生叶紫溪经过一系列的接触终于走到一起，正当两人爱意浓浓的时候，当地有名富商之子周伟宸也看上了叶紫溪，并通过手段让叶紫溪进入了自己的集团公司做私人助理，但正直的叶紫溪并没有给他任何机会。周伟宸利用叶紫溪父亲赌鬼的身份借高利贷并趁机扣押了他，以此要挟叶紫溪妥协，这时商业对手也利用此机会对周氏集团发难，关键时刻周梓易得知自己居然是周氏富商私生子，并掌握了周氏的实际掌控权。狗急跳墙的周伟宸居然吃里扒外，和外人一起对付自己的公司，并为了威胁周梓易绑架了叶紫溪，最终被周梓易成功化解了危机，并带领周氏集团重塑辉煌。
