2262年，地球军上尉伊丽莎白·洛克利被任命为巴比伦5号空间站的指挥官。该空间站逐渐发展成为逃离灵能部队的叛变心灵感应者的庇护所，并由此引发了冲突。前纳尔恩驻巴比伦5号空间站大使格卡尔，在纳尔恩-半人马座战争期间被监禁期间所著书籍出版后，不情愿地成为了精神偶像。德拉克人，曾经的暗影联盟盟友，留在银河系，通过一种名为守护者的寄生生物控制了半人马座主星上的摄政王维里尼，并挑起半人马座与星际联盟之间的战争，目的是将半人马座与星际联盟隔离开来，为自己争取一个可塑的家园。
故事讲述石中玉、石破天乃自幼失散之孪生兄弟，破天与父母失散，辗转成为长乐帮主。中玉则自幼受父母溺爱，行事只为个人喜恶，闯荡江湖期间分别结识叮当，铁珊瑚，冬儿及侍剑 ，展开一段五角恋爱。雪山派掌门白自在误会中玉巫害死其孙女白阿秀，开声讨大会对付中玉，阴差阳错，中玉与破天互调身份，并展开一段段奇遇。及后，中玉，破天相认，同赴侠客岛，角开武林高手相继失踪之谜，最后，二人更同练“侠客”神功，联手对付野心控制武林之贝海石，展开连场恶斗……
为了来之不易的新挚爱，巴瑞迫切希望逃离自己的过往，全身心投入到表演当中。然而职业杀手不是想不干就能不干的，而且诉诸暴力似乎并不只是外力作用的结果——一开始到底是什么让巴瑞拿起了屠刀？
第六季中，故事始终以两条叙事线索展开。其中一条，他们在岛上。另外一条，他们也坐过那班飞机，但飞机没有出事，因此每个人都在岛外过着完全不同的生活。戴斯蒙发现两个世界之间的连接点，他于是一个个地去找那些曾经同机的人，用各种极端的方式让他们“回忆”起在岛上那段其实他们并没有经历过的日子。很多从不相识的人因此走到了一起，相爱，幸福地生活在一起。而在岛上，他们早就因种种缘由失去了彼此。最后，杰克在父亲的葬礼上见到这些同伴们幸福的笑脸，他也笑了。一直以来在宿命和责任中挣扎的杰克，在“醒”来的那一刻，真正解脱了。
小川爱实（木村文乃 饰）是私立女校的国语教师，成长于保守家庭，生活按父母安排步步推进，却逐渐对婚姻与人生感到迷惘。某日，她为拯救被牛郎欺骗的学生，闯入夜店，与牛郎俱乐部“THE JOKER”的男公关熏（拉乌卢 饰）邂逅。熏出身贫困，识字困难，却凭温柔与努力生存至今。两人原本无交集，但在展开秘密“私人辅导”教授文字与社会常识后逐渐拉近距离，在冲突与理解中渐生情愫。然而，社会的偏见、指责与嫉妒接踵而至，由此展开一段跨越世俗的纯爱故事。
