本剧集故事承接第一部剧情，讲述汉武帝刘彻（黄晓明饰）经过五年执政后进入他实施雄才大略阶段的故事。已坐稳皇帝宝座的刘彻，此时却触景生情，感慨当年亲如手足的兄弟们多已不在人世，唯一仍在人世的李勇（杜淳饰）却陷落匈奴手中，东方朔也一去不复返。历经千难万险寻找李勇下落的秋蝉（刘芸饰），终于在匈奴找到他时却发现他已与匈奴公主成婚。汉武帝微服出游，邂逅长相酷似已逝的陈阿娇的歌伎李娃（何佳怡饰），不禁怜爱有加。不久李娃入宫成为刘彻的新宠。然而已为皇后的卫子夫（宁静饰）却预见陈阿娇的前车之鉴又要重演。汉武帝派汲黯（杨洪武饰）去寻访东方朔，无意间遇见了怀才不遇的狂士主父偃（王刚饰），认为是奇才，遂力荐主父偃入宫辅佐汉武帝。汉武帝听信谗言，将卫青（董勇饰）的兵权交给霍去病（李立饰）。

间宫贵子（天海佑希 饰）是一名能力优秀的律师，在离开了曾经栽培过她的律师事务所之后，自立门户的贵子信心满满的希望能够开拓出一片属于自己的新天地。令贵子没有想到的是，接踵而至的意外让她的事业很快就跌落到了谷底，在无奈之中，她只得抛弃曾经的成绩与骄傲，改头换面，重新来过。随着时间的推移，菜鸟大学生本多大介（玉山铁二 饰）、居心叵测的前台接待米姆拉（吉田香织 饰）、比起律师来更像是商人的佐佐木藏之介（柳田俊文 饰）等人聚集到了贵子的门下，靠着这一帮半吊子职人，眼前是困难重重的险山恶水，贵子真的能够完成自己的梦想吗？ 

　一代天骄成吉思汗是闻名中外的蒙古族及中华民族的英雄，是公元后第二个千年最伟大的人物之一。本剧全面介绍了成吉思汗的一生：十二世纪中叶，中国北方在金朝统治之下。大漠南北草原各部还各自独立，互不统属。金朝对其实行“分而治之”和屠杀掠夺的“减丁”政策，蒙古部首领俺巴孩就曾被金熙宗残酷地钉死在木驴上。正是这种几代冤仇导致了草原内外的长期征战，孕育了以征战为主要生活内容的一代天骄！在十二世纪末至十三世纪初，成吉思汗以其杰出的政治谋略和正确的战略战术结束了蒙古草原四分五裂的局面，完成了蒙古族的统一。十三世纪初，他又以血族复仇的名义率领十万蒙古铁骑直指金朝的中都（今北京），能征惯战的女真人不堪一击，中都很快被攻克。后因林木中百姓叛乱，成吉思汗率主力回到蒙古草原；又因西方大国边将杀死近五百人的商队，其国王又杀死蒙古正使，成吉思汗才被迫进行了西征。蒙古铁骑兵锋所指，多少支军队被打得人仰马翻，多少个王公贵族纷纷人头落地：不可一世的西方对手被消灭了，其统治区域成为剧烈争夺的战场。成吉思汗临死前还逼迫西夏王表示投降，并留下了灭金、灭夏和如何巩固政权的三条遗嘱。为统一中国北方、进一步统一全国打下了基础。对于成吉思汗的千秋功罪，我们中国人民是最有权力评说的！

宇文峰（郑少秋 饰）出身武当，勤学苦练，身手了得，学成下山后，宇文峰受到了当时最大的兵器工厂唐门的赏识，门主更是将女儿唐碧（汪明荃 饰）许配他。哪知道唐门突遭不幸，被诬陷勾结外族，落得满门抄斩的下场，而宇文峰则被打入大牢，即将问斩。太监张诚（陈鸿烈 饰）欣赏宇文峰的身手为人，以替他卖命作为条件，救下了宇文峰。

玉珞君是位人称“爵士王子”的二十世纪三十年代上海电影明星夜总会的小号手。他很有艺术天赋、情感细腻但又有些软弱。富家小姐许柯茹一见钟情爱上了与之邂逅的他，由于门第相差悬殊，他们的相爱遭到了许父的强烈反对。柯茹和玉珞君毅然私奔来到苏州，两人相依为命，许父后来也接纳了他们。抗日战争爆发后，玉珞君和柯茹母子在混乱中失散。玉珞君搭船到了香港，后来又辗转到了新加坡，一次一次的阴差阳错，玉珞君始终没能与柯茹重逢，后来与善良的农家女林秀结为夫妻，柯茹却一直坚守着心中的爱，拒绝了一直爱慕她的周宇光。二十几年过去了，柯茹终于与玉珞君相见，然而物似人非，玉珞君左右为难，但他们彼此最后终于明白了，原来他们真正的爱人其实多年来就在身边。

宇文峰（郑少秋 饰）出身武当，勤学苦练，身手了得，学成下山后，宇文峰受到了当时最大的兵器工厂唐门的赏识，门主更是将女儿唐碧（汪明荃 饰）许配他。哪知道唐门突遭不幸，被诬陷勾结外族，落得满门抄斩的下场，而宇文峰则被打入大牢，即将问斩。太监张诚（陈鸿烈 饰）欣赏宇文峰的身手为人，以替他卖命作为条件，救下了宇文峰。那边厢，唐碧死里逃生，之后成为了京城第一大镖局的女当家，丈夫死后，唐碧接管了镖局，并且最终凭借她的智慧和能力获得了周围人的认可。宇文峰加入了锦衣卫，受张诚胁迫，干尽了伤天害理之事，一次偶然中，宇文峰和唐碧重逢了，一段旷世情缘再度拉开帷幕。

陈金城（郑耀中、韩宜邦饰）自幼家境困顿，父亲（陈博正饰）为打铁师傅，母亲（黄婕菲饰）体弱多病；艰困的环境，养成陈医师的坚毅性格。金城好学不倦加上很有读书天分，从小品学兼优；而老师们的协助，更让他习医过程一路顺遂。台大医学院毕业后，在台大接受住院医师训练时，木讷的金城遇见了生命中最亲密的伴侣，朱恬仪（陈怡嘉饰）。听闻大林慈济医院即将开办后，他毅然回乡服务；从大林慈院试营运时期就全心投入，一个人负责一科，独撑大局，艰辛的维持了四年。一向只为病人着想、从不喊累的金城，幸好有家里贤内助的恬仪、医院专师玉玲（黄瑄饰）的协助，总算不负乡亲与慈济医疗志业的期望，让大林慈济成为云嘉南地区神经外科医治疑难重症的首选。大林慈院的神经外科，陆续有医师报到，分担金城肩上的重担。任职副院长的金城，以为责任稍轻时，却免不了面临生老病死别离苦，让孝顺的金城与恬仪夫妻俩心力交瘁，但失去亲人的痛，也让金城在大医王生涯里有着领悟，以前他只懂得医身，现在的他懂得医心，医的不只是病人心、家属心，同时也医着自己的心。

曾经，一个高度发达的先进种族Ancient以地球为基地，几百万年前，不知什么原因，他们离开地球去了某地，在南极只留下一个前哨站。在Jack O'Neill将军用前哨站的一种Ancient武器消灭前来攻击地区的Goa'uld人的舰队之後，各国合作建立了南极联盟，为研究前哨站里的Ancient科技、促进国际合作与和平而共同努力。在研究过程中，他们发现了Ancient离开地球后所去的地方——飞马座星系。于是，为了发掘被埋没的历史、探索未知的世界，各国组建了亚特兰蒂斯探险团队，通过星际之门到达了几百万年前从地球飞走的亚特兰蒂斯城。