故事设定在《废头》世界的1042年前,以机器人“罗宾”作为主角。罗宾原本作为护卫,随同调查队长特里斯前往地下世界调查异常情况。尽管肩负保护特里斯的使命,但调查队却遭到了人工生命体马里甘的邪教组织“吉拉教”的袭击。在压倒性的战力差距下,调查队陷入苦战。然而,在这场激烈的交锋中,他们发现了次元的扭曲,并逐步揭开地下世界隐藏的秘密与异变的真相。
蝙蝠侠和他的盟友们从过去回来后仅仅一天就发现世界已经和他们离开时大不相同了。整个日本岛不复存在,正义联盟的英雄们也不复存在。但他们还没来得及弄清楚发生了什么,黑帮就开始从天而降。