柏飞（陈山聪饰）、姜曦文（刘佩玥饰）、刘力（林子善饰）投身警队后师从罗友邦，四师徒感情深厚。三年前的追捕行动，友邦殉职、刘力重伤，曦文归咎于柏飞急功近利引致悲剧，友情破裂。一宗连环谋杀案再将柏飞、曦文联系起來，卧底温嘉莉（刘颖镟饰）奉命混入犯罪集团，却重遇前男友招俊朗（张振朗饰），关系纠缠不清。柏飞、曦文接二连三收到神秘讯息提示，上级遂将两组探员合并成神秘讯息情报科，侦查多宗扑朔迷离的命案。由手机助理发出的提示为何每每能引领团队超前破案，「她」是敌是友？
因鉴宝负债的鬼马少女郑梓玥被迫与高冷密码天才陈奉一联手，限时48小时破解600年前郑和下西洋的秘密，却被迫卷入神秘势力混战。神秘飒姐截胡、搭档突然反水、父亲失踪谜案连环暴雷，最终发现阿公以命守护的“宝藏”竟另有深意！一对欢喜冤家在冒险中擦出火花，一个不可能完成的任务最终绝地反击！
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在上一季中，朗娜由于用元素石自卫，而杀了人...元素被污染引发了流星岩直接撞击地球一个小镇---史摩维尔。朗娜逃亡中不幸坠机后究竟看到了什么？而另一方面，克拉克无故消失在洞穴中却出现南极腹地...克洛依和ＬＥＸ究竟发现了克拉克的秘密没有呢？...在这一季中，一切迷团的答案....
