今鸟星，以国家为单位组成的庞大星球。大国之间常因争夺领土而开战。实力强大的厉国合虚合国开始争夺领土，厉国最强组织“刺”的成员——罗格格多（男主父亲）被指认为叛国者，导致罗格自幼和母亲备受欺侮，丧失立锥之地。在和同伴的斗争中被“刺”成员百鸟凰救下，并受百鸟凰指引进入世界上最混乱，最恐怖的恶人学院，进行修习历练，同时寻找世人口中父亲叛国的真相。而在恶人学院和拥有强大战灵的对手抗争中，罗格被激发出最神秘的黑色“战灵”却无法自控，后由落日学院副院长进行压制，然而罗格对自己体内的神秘...
博派现在必须和极限动物并肩对抗狂派，狂派则与掠食金刚联手，拼命找寻下落不明的火种源。然而，黄金光碟却掌握在掠食金刚的手中，这款难以捉摸的文物不仅跟密卡登切身相关，还能赋予他强大的优势，用来压制死对头柯博文。这场最终之战将决定赛博坦的未来，究竟哪一派人马能胜出？
在远离大都会的小山村，住着巫女世家出身的高中女孩宫水三叶（上白石萌音 配音）。校园和家庭的原因本就让她充满烦恼，而近一段时间发生的奇怪事件，又让三叶摸不清头脑。不知从何时起，三叶在梦中就会变成一个住在东京的高中男孩。那里有陌生的同学和朋友，有亲切的前辈和繁华的街道，一切都是如此诱人而真实。另一方面，住在东京的高中男孩立花泷（神木隆之介 配音）则总在梦里来到陌生的小山村，以女孩子的身份过着全新的生活。许是受那颗神秘彗星的影响，立花和三叶在梦中交换了身份。他们以他者的角度体验着对方的人生，这期间有愤怒、有欢笑也有暖心。只是两人并不知道，身份交换的背后隐藏着重大而锥心的秘密……
