故事发生在1944年，第二次世界大战接近尾声，日本帝国主义在海外的攻势也成为强弩之末。历经八年战火荼毒的中国，就此也到了生死存亡的决定时刻。中美英三国策划对日寇发动联合反击，肩负着艰巨使命的美国飞虎队王牌飞行员卡恩驾驶P-40战斗机飞临滇西上空，谁知却遭到此前获悉情报的日本空军的狙击。经过一番对决，卡恩的飞机遭到重创，他也不得不跳伞落入了滇西的密林之中。日军阳光司令部旋即派兵展开地毯式搜索，而八路军游击队、美军伞兵特遣队、国民党远征军也分别开始了营救行动。
恩英（刘一含 饰）是个韩国料理师，她与中国击剑选手张林（高曙光 饰）因误会生爱，俩人约定了后续前缘的时间，不料天有不测风云，在约定的时间内张林因突遭意外失约，恩英在这期间生下了两人的爱情结晶湖水。恩英的好友秀泰意外过世，丢下儿子湖真，恩英为生计所迫，开了一家面馆，同时养育着湖水与湖真。不久，积劳成疾的恩英患上癌症，自知不久于人世的恩英托润美（王思懿 饰）带上湖水去中国寻找他的生身父亲张林，而内心龌龊的润美在陷害与其同居多年的男友金宝（娄亚江 饰）后，采用狸猫换太子的卑鄙伎俩，带着湖真前往中国，不明就里的张林与她结了婚。在韩国保育院长大的湖水（尹施允 饰）秉承了妈妈做面的手艺，他越洋来中国寻找从未谋面的父亲...
年代战争题材 这个戏写的是白洋淀雁翎队的故事，大家知道的《小兵张嘎》说的就是那里的事儿，不过《水上游击队》的主人公是游击队的队长魏光明和副队长丁水妹，嘎子在里面晃了一眼，只是一个很小的配角，按照现代的人性观念，我觉得让一个小孩子去打打杀杀是不太人道的。真实的战争是残酷的、枯燥的、恐惧的、混乱的，肯定不像文艺作品中那么曲折离奇、悬念迭出、激动人心。为了让戏好看，正邪双方的力量和对抗都加强了很多，而且，本剧中的各方都足够聪明，因而对杀起来就更加扑朔迷离、惨烈异常，看过剧本的同志评价，这个戏的节奏和对抗性都很“美剧”。另外，在创作剧本的时候还保留了一点私心，尽可能地还原历史的大背景，比如并没有刻意丑化日军，对于我军“平型关大捷”、“百团大战”尽量去除水分，做客观描述，对国军在抗战中的贡献有所交代，还特意安排了一个前国军的营长参加雁翎队，做教官。
平凡家庭中长大的天才游泳选手白泳泽与家道中落的千金小姐宋茶茶在人生低谷中相识，成为欢喜冤家。泳泽的好友蓝天因为秘密不得不离开未婚妻茶茶。因此，在事业、友情、爱情面前，泳泽和蓝天从好友变成竞争对手。经历了严酷训练，二人在成为国家队成员的终极一战中展开对决。蓝天父亲设局让泳泽被迫放弃比赛，得知真相的蓝天战胜内心的胆怯，捍卫了竞技体育精神，毅然归还本应属于泳泽的荣誉。三人在经历诸多波折后成长为有责任感、性格坚韧、内心阳光正直的出色青年。
