在世界各地,憨豆先生这部片受到了广大人的喜爱,借此继而又推出这一睰《憨豆先生动画系列》。憨豆先生是个智商号称“007”他有一点笨拙、有一点幼稚、有一点单向思维(脑筋不转弯)，有一点腼腆，最重要的是，他还是个思维有一点短路的家伙，他的喜剧感乃来自你我都有可能会发生的日常生活中。剧中对白极少，几乎都是靠他“丰富的肢体动作”和“变化多端的表情”来呈现。这部片的主人翁是按电视主角罗恩艾金森的形象构图而成，故事的内容构思巧妙、创意搞笑。
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这里是某中学的理科室————。科学部部长上野，是恋慕着部内学弟田中的恋爱少女。她使用天才过头的异想天开发明品，采取各种手段试图吸引田中的注意。一年级的部员山下也以沉着冷静的辅助来支援上野！上野的恋情究竟能否成功！？
纱名（大和田仁美 配音）自幼生活在“研究所”中，从未涉足过外面的世界。她拥有能够任意改变周遭物体的超级能力，因此被当做“危险品”一般受到重重监护。某日，再也忍无可忍的纱名逃出了研究所，随即遭到了组织的追捕。无处可去的纱名在走投无路的境遇下遇见了名为㭴村藏六（大冢明夫 配音）的老者，善良的老人收留了纱名。藏六和孙女早苗（丰崎爱生 配音）过着相依为命的生活，如今家中多了一个女孩，生活倏地热闹起来。和纱名一起逃出来的，还有个性大大咧咧自由奔放的雏雾朝日（藤原夏海 配音）和她的双胞胎妹妹雏雾夜长（鬼头明里 配音），女孩们所要面对的，是步步紧逼的研究员以及她们扑朔迷离的身世。
