邪王石之轩武功盖世，但他害怕自己的一身邪恶武功将来为祸人间，于是将自己和封存住巨大功力的邪帝舍利一起冰封在邪王墓里面。进入邪王墓的唯一钥匙就是记载着上乘武功的秘笈《长生诀》，因此江湖上人人都想得到它，但它已经失落于江湖多年，无人得知它的去向。另一方面，杨州城的两个自幼相依为命的孤儿寇仲（林峰 饰）和徐子陵（吴卓羲 饰）虽然一直在干些小偷小摸维持生计，但二人天资过人，都希望学成一身好武功将来出人投地，于是想拜当地的石龙道长为师。岂料去找石龙的时候，发现石龙正与一武功高强的女子傅君婥相斗。
新一季的剧情据报会偏离原作播客的内容，引入新角色及演员。Janelle Monáe饰演一名固执的女子，醒来时发现自己在独木舟上漂浮，而且失去了为何来到此处﹑以及她是谁的记忆。
民国初，山东济南武林高手“燕子李三”被官府斩杀。李三师弟李显隐退江湖，将绝世轻功传与徒弟李云飞、李云馨、李云龙。十年后李显师徒回到济南，与日本武士对决抗争，名声大振.百姓称，燕子李三回来了。抗战时期，李显师徒投入到全民抗战的洪流中。三徒弟李云龙薄弱的内心和膨胀的私欲，使他最终成为了彻头彻尾的走狗，不得善终。二徒弟李云馨开武馆，传授武艺。大徒弟李云飞体会到，凭借武林气节，单打独斗，不可能真正救国，毅然加入抗战。
在上一季中，以果敢干练的作风和高超惊人的医术，人称 “Doctor X”外科医生大门未知子（米仓凉子 饰）在早已形同腐臭泥潭一般的帝都医科大学第三医院力挽狂澜，掀起前所未有的风暴。因在北海道马场冒险为一匹骨折的马做手术，未知子得到内科专家马渊一代（三田佳子 饰）的赏识，进而受邀踏入全日本顶尖医者云集的殿堂——帝都医科大学附属医院！此前不久，外科总负责人蛭间重盛（西田敏行 饰）曾亲手为医院的大金主——某地产大鳄二宫钦也（寺田农 饰）完成高危手术，谁知此番二宫癌症复发再度入院。第二外科主任海老名（远藤宪一 饰）携团队积极备战，配合蛭间迎接新一轮的手术。而马渊所率领的内科则就治疗方式上与外科产生严重分歧和对立。未知子的到来，无疑使双方的矛盾趋于白热化…
