几位制片人透露，编剧组目前已经制定出完整的「第二季剧情线索蓝图」。第一季结尾留下了很多疑问，其中最大的一个是：究竟存在多少个平行世界？Olivia已经亲身经历了其中的一个，她还会经历另一个吗？大多数DC漫画中所描述的「无限地球」概念（Infinite Earths），会出现在《危机边缘》中吗
韩东山是凤凰台滑雪场新来的教练，对自己过去一字不提，跟其他人相处也非常冷漠。但善良的滑雪场接待员赵晓晴，却不断表示关心，让东山渐渐打开自己心扉。而后东山在酒吧发现了晓晴，无论东山如何劝说，晓晴都不承认自己精神有问题，这让东山极度困惑。晓晴另有爱慕者，是高富帅的心理医生阮弘光，也是凤凰集团创办人的侄子。东山发现晓晴因为幼年时不愉快的经历，成年后造成严重的心理问题，这种情况已经严重危害到晓晴的身心健康。但如进行治疗晓晴有可能会使她忘记所有的现实生活而活在一个未知的心理环境中，更可能使东山永远失去晓晴。但为了晓晴的健康东山义无反顾，终于在弘光的协助下，让晓晴面对自我。
锦州战役中，解放军军官马龙在战场上营救了一个年轻的女大学生莫莉，但他不知道，莫莉的未婚夫林午阳，其实就是自己要一心寻找复仇的国民党“恶魔中校”。莫莉留在了解放后的沈阳，终于等到林午阳的出现，不料他仍然偏执地相信国民党军队会打回来，一次次利用莫莉的爱情，给自己做掩护。马龙的热情真挚和林午阳的冷酷阴鸷形成强烈的对比，莫莉苦苦挣扎在理智与情感之间，一方面与林午阳的多年情感无法割舍，另一方面又无法抗拒地被新中国和马龙朝气蓬勃的精神所感染和吸引。在组织和马龙的关怀和感染下，莫莉终于看清了林午阳的反动残余本质，关键时刻弃暗投明，协助马龙一同粉碎了林午阳的狂妄计划，同时也完成了对自身的救赎，坦然面对马龙的爱情。
解放重庆的最后一次战役打响后，西南特区代区长廖一潭部署渣滓洞白公馆特务和刽子手潜逃、潜伏等有关事宜，并全权负责指挥执行一项代号为C30计划的秘密行动。一直隐蔽在敌人内部、代号叫“山鹰”的地下党员将敌人行动目标通知了地下党后失去联系。刚刚建立的重庆市公安部长刘灿作出了三个重大决定：一是吸收地下党联络员黄菊芳加入公安队伍，尽快联系“山鹰”，二是启用伪警察赵金斗加入刑警队；三是组成敌特人员甄别小组。潜逃人员接二连三的袭击解放军，破坏市政重要设施，公安部损失惨重。绰号叫“猫头鹰”的刽子手，多次化装在市区出现破坏，却几次逃脱。周畅经过千辛万苦，终于把“山鹰”的情报送出，公安部周密部署，最后抓获了全部执行C30计划的刽子手。
