上世纪30年代末，古老的中华大地正经受着最为苦难的时刻。外有日寇铁蹄进犯，内有不同派别势力的斗争碾压，战火连绵，生灵涂炭。为了获取重要的情报，共产党方面派出周乙（张嘉译 饰）和顾秋妍（宋佳 饰）假扮夫妻，潜入哈尔滨的警察厅特务科。周乙被任命为特别行动队队长，但他的真实身份一直受到高科长（程煜 饰）的怀疑。
《被告人》围绕着一个强力检察官成为死囚逃脱罪名的故事而展开，讲述了故事的主人公是一个未认证过被告人有罪的大韩民国最佳强力检察官，一系列的突发事件是他沦为被关在监狱看守所里的人。而更为糟糕的是他在一系列事件发生之后记忆全部暂时丧失，这为他洗刷冤屈增添了不少的难度。他也进入人生最糟糕的两难选择，开始陷入检察官的迫切殊死的斗争中。
