为了逮捕宇宙罪犯（天才科学家）畸咕，银河警备队队长青龙一路追捕，但是在和畸咕战斗过程中掉入陷阱，误打误撞来到了地球。在地球上，青龙结识了善良、正义的小男孩天翼。不料畸咕也跟随着来到地球，在发现地球有丰富的物种资源之后决定改造地球生物成为他自己的军队。为了阻止畸咕侵略地球的计划，青龙、天翼和他们的伙伴们踏上了维护地球和平的全新征程。
电视剧版《功夫熊猫》集中讲述了熊猫阿宝在成为“神龙大侠”不久后又面对的重重艰难考验，剧情将填补两部电影版《功夫熊猫》之间的空隙，人物设定将沿用电影版，“中国元素”仍将成为其亮点。此外，电视剧版《功夫熊猫》中将出现不少新角色，“他们大都是反派，功夫盖世，对阿宝造成不小的威胁。”
