西南国境线上以“风暴”为代号的武装控边行动打响前，行动指挥部连续接到通报：边境上出现了一支有国际背景的盗猎集团，另一支联合国科考队的十九名科学家突然集体失踪，而“风暴”行动突击分队队长、年轻的上尉军官肖沐天则因陷入一连串边境事件被取消了晋级命令，同时失去了担任“风暴”行动突击分队队长的资格。边境事件事关重大，上级命令肖沐天从边境回到军分区接受调查，并责成肖沐天将事件的肇事者、年轻的鸟类摄影师古蒙儿、志愿兵郝大地、军犬九毛九一同带回军分区接受调查......
1937年，中华民族进入了最为苦难的一段时期。日寇侵华，血腥的铁蹄踏遍神州，熊熊战火灼烧着祖国每一寸土地。在国难当头的危机时刻，留学多年的数学博士陈家鹄（郭晓冬 饰）携日籍妻子惠子（尹媗 饰）回国，希望奉献自己渺小的光和热。由于他在国外曾对日本的电报密码有所了解，因此陈成了日寇急欲猎杀的目标，也成为国民政府积极网络的对象。经过一番波折，他最终加入国民党军统下辖的密电破译机构“黑室”的一员，虽然憎恨国民党的腐败，但是受制于人的陈仍被迫为黑室工作。在此期间，他和惠子也因身份的特殊屡遭军统刁难。与此同时，我党人员成功打入黑室，为了新中国的建立做着最后的努力……本片根据著名作家麦家的同名小说改编。
