故事发生在大唐宪宗的永贞元年，朝中阉宦势力，特别是权倾朝野的俱公公，横行无忌，令人发指。木相国的女儿木芙蓉因继母秦氏的逼婚与压迫而倍感绝望。在一次绝境中，她决定跳下绣楼寻求解脱，千钧一发之际，她被夜行侠所救。夜行侠是个专门惩治贪官污吏的义士，隐藏着复仇的目的。他与木芙蓉之间迅速产生了深厚的情感，但俱公公察觉到他们的关系，开始对木芙蓉施加压力，逼迫她与秦阙成婚。为了保护木芙蓉，夜行侠冒险出手相救，但在与俱公公的势力对抗中身受重伤。
失忆总裁沈池宴把哑女妻子宋柒年当作秘书，甚至让她作白月光的备用血包。宋柒年有口难言，企图帮沈池宴找回记忆却失败。苏醒的白月光使计破坏宋柒年的家庭，在爱情破碎和亲人离世的多重刺激下，哑妻居然开口了！
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
卫刚（孙淳 饰）是华东医院的院长，他的妻子亚玲（李凤绪 饰）因为精神问题常年居住在疗养院中，而两人的独生女蓉蓉（张歆艺 饰）则和名为郝好（高鑫 饰）的男子交往多年。在卫刚六十岁生日这天，亚玲和蓉蓉都回到了家中为卫刚祝寿，郝好更是借此良辰美景，大胆的向蓉蓉求婚。可是，也正是在这一天夜里，郝好的老师宗凤（江珊 饰）痛失爱子斯宁（袁文康 饰），她将一台手机放在了斯宁的墓地之中，整日深陷在悲痛中，日日拨打着这个根本就不可能会接通的号码。然而，某日，这个号码却意外的接通了，电话的那一头，是一个名为马东（袁弘 饰）的陌生男子。
