第三季故事紧接第二季结局，前卧底警察出身的黑帮成员Elliot如今作为一名顶级罪犯，与Dumani一家共同行动。当他们的可卡因运输被阻挠后，生意陷入一片混乱，并导致了伦敦各地数百名平民死亡。接连不断的混乱引起了当局的注意，给伦敦的帮派带来了前所未有的压力和一系列连锁反应，从Wallace一家到Luan，再到Lale和街头帮派，他们的个人生活和职业都将面临毁灭性后果。这是一次有针对性的袭击，并且只是个开始，但问题是——是谁干的，为什么这么做？
继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。
