在一座远离大都会吵闹喧嚣的平凡小镇，不甚兴旺的兔子山商业街内，生活着一群可爱有趣的人。故事的女主角北白川玉子（洲崎绫 配音）是当地饼店“玉屋”的长女，她性格活泼随和，擅长制作饮食，与对门面饼店“大路屋”的儿子大路饼藏（田丸笃志 配音）是一对青梅竹马，不过两家的爸爸是典型的同行冤家，彼此一见面便战火不断。这一日，玉子在花店意外发现一只会说话的鸟（山崎巧 配音）。鸟自称来自南方，肩负着神秘使命。鸟的到来自然为玉子和周边人的生活增添不少乐趣，而快乐浪漫的青春校园生活又令人心驰神往。
故事中的妖怪，大部份出自鸟山石燕的《图百鬼夜行》和竹原春泉的《小人儿书一百故事》的妖怪画集。奴良陆生表面是一个13岁的普通初一学生，但实际却是妖怪“滑头鬼”的孙子，拥有四分之一的妖怪血统，白天是一个普通少年，到了晚上则成了一个妖怪。 儿时的他非常崇拜爷爷，并且非常喜欢爷爷手下的“奴良组”。因为父亲奴良鲤伴很早就已经去世，本应该继承“奴良组”三代目的陆生却因为不愿自己成为同学惧怕和讨厌的妖怪要拒绝继承。直到有一天，一心想成为滑头鬼妖怪元兴寺为了打击报复奴良家袭击了陆生和同学一同乘坐的校车。求人心切的陆生本能地召唤出妖怪的血统，救出了同学。最终他到底会选择成为妖怪吗？
混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化……与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
