时间为战国时代，世上所具有的各种魑魅魍魉、异形妖怪等非人灵力生物总称为”暗“。喜欢人类的暗——妖狐玉，以及厌恶人类的仙道——迅火，成立了名为“救世姐弟”的组合进行著扫荡罪恶的救世活动，途中遇上了武士兵头真介。另外还有一群专门对付暗的僧侣·断怪众，他们为了消灭对人类作恶的暗“障怪”的以不人道的方式进行人体改造，迅火等人与他们产生激烈冲突！人类当中也有坏人，非人类的存在也不见得都是邪恶的，迅火因过去的事而极其讨厌人类，但在旅程当中，也逐渐目睹到人类善良的一面，他是否能有所转变呢。
在几乎整个人生中都被恶霸包围的哈罗德·凯尔普，一个雄心勃勃但经验不足的发明家，同时也是朱利叶斯·凯尔普教授的孙子，对科学还有很多要学习的地方。当他的一项实验失败后，哈罗德决定进入他祖父的科学学院，并爱上了美丽的波莉·麦格雷戈。为了给她留下深刻的印象，哈罗德获得了一种强效血清，就像《疯狂教授》（1963年）中那样，发生了一次剧烈的转变。历史是否在重演呢？
这里是某中学的理科室————。科学部部长上野，是恋慕着部内学弟田中的恋爱少女。她使用天才过头的异想天开发明品，采取各种手段试图吸引田中的注意。一年级的部员山下也以沉着冷静的辅助来支援上野！上野的恋情究竟能否成功！？
从京都深处逃出的铃木凛（虎彻 饰）投靠了哥哥曾经就职的东京侦探事务所所长久远美保。与此同时，黑道知名的傀儡大师帝门达也接到了暗杀久远美保的委托。达也认为虎彻会成为自己任务的障碍，于是将目光锁定在了虎彻身上。然而，经过几次交锋，两人逐渐察觉到彼此的存在。最终，委托人自杀身亡，达也也不再有任何理由将虎彻作为目标。从此，达也成为了虎彻的盟友，两人的关系也逐渐亲密起来。与此同时，黑道分裂为东西两方，西方势力的影鳄潜入了达也等人所属的东方势力。这引发了两方黑道之间的冲突，虎彻等人也卷入其中。经过一系列的战斗和事件，黑社会的冲突最终以东方的胜利而告终。
家族工具人“影子”萨尔为家族抛头颅洒热血后，却被家族抛弃。靠吸食萨尔的血肉能力以及一切成为新家主的艾伦库珀宣告了萨尔悲惨的死亡结局。不料萨尔重生回到成为“影子”前一天，这一次，他会向那个肮脏卑劣的艾伦挥刀复仇，夺回自己的荣耀！
