公元2005年突然入侵的宇宙海盗在地球收齐了12个宇宙胶囊，并利用其力量完成了对地球的征服，整个地球被黑暗笼罩。到了公元2500年，地球和其他星球的人组成反抗军将一支小型舰队送入虫洞回到2005年以便改变历史，鲨鱼队长率领的战士，超星舰队！
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立志成为哇星勇士的韩醒、金灿灿、崔龙起三人，在执行任务时被黑衣人偷走了三人情丝。有重大嫌疑的出入界安检员解梦恰好也不见踪影。 三人来到办事处投诉，出入界使者为了不让事情闹大，承诺“只要将罪魁祸首带回来”，就帮他们拿回情丝。 现世寻人无疑是大海捞针，三人只好就此安顿下来。韩醒化身为时尚总监，并坐拥一家名为√13的餐厅，金灿灿是主厨、崔龙起成了健身教练，随时打探消息。 就在他们一筹莫展的时候，√13急需一名奏乐师，转界后的解梦，来韩醒所经营的餐厅应聘奏乐师，但她俨然已忘记当初在出入界管理所的种种事宜。 在“√13”日常的“尔虞我诈”之中，各种不可描述的情愫不期而至。
美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一起离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今下落不明。从此穆德便专注于神秘事件的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，难以驾驭。FBI高层从联邦调查局学院调来女性探员黛娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰），表面上是协助穆德工作，实际上是希望这名崇尚科学的理性探员能够制约穆德的行为。两人最初的合作并不理想，完全不同的思维模式时刻导致争论的爆发。但随着各种离奇案件的出现以及两人交往的加深，穆德和斯科莉最终变成可以为对方出生入死的可靠伙伴……
