伴随着魂导科技的进步，斗罗大陆上的人类征服了海洋，又发现了两片大陆。魂兽也随着人类魂师的猎杀走向消亡，沉睡无数年的魂兽之王在星斗大森林最后的净土苏醒，它要带领仅存的族人，向人类复仇！生活在斗罗大陆上的少年唐舞麟因为武魂是蓝银草，一直被嘲笑轻视。一次意外受伤中他发现：自己身体里面有一条由18道封印封禁的金龙，守护着自己的那缕神识告诉他，如果不逐步解开封印，自己将爆体而亡……
蓝松鸦和浣熊二人组每天都会经历超现实的冒险，它们试图处理作为当地公园的场地管理员的平凡工作。
讲述了SPT先锋小队在帕索尔星帮助麒麟夺回火之翼，麒麟告诉SPT先锋小队去巨石星卡图冈之门自然会找到无尽能源的答案，SPT先锋小队听了麒麟的话，去巨石星找卡图冈之门的事。战神联盟也将登场。盖亚的哥哥瑞尔斯以新形象和重要角色的身份再次登场，本季动画中将有许多新角色登场，麒麟、魔圣尤尼卡、海盗四魔将之一的吉约等新角色登场
这是导演佐藤达夫的突破之作，他后来凭借《火星继承者：抚子》一举成名。这部动画讲述了三个少男少女组成的“少年侦探社”侦破神秘案件的故事，充满了戏仿的元素。五年级的小学生花冈勇和她的同学月影俊、雪见聪在一间仓库的地下室里发现了她们祖先——新选组的记录。三名少女意识到她们的使命是对抗邪恶的黑天狗一族，于是她们带着“新选组”（一群正义的盟友）给予她们的三件物品，出发去惩罚黑天狗一族以及在小镇上肆虐的各种恶棍。
