第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。
敌后抗日武工队是华北抗日战场上最闪亮的传奇，高风亮领导的定西县抗日武工队坚持敌后抗战，随时出击神出鬼没，如同一把尖刀插在鬼子心里，让鬼子时时心如刀绞，痛不欲生。抗战后期，鬼子进入最后的疯狂，为剿灭武工队，定西鬼子特战队队长冲田新八，多次设下圈套，敌方汉奸队、鬼子特务大队，甚至我军情报站，都成为了冲田新八的诱饵。高风亮在鬼子陷阱面前率领战士们一次次虎口脱险的同时，完成了护送首长、定点锄奸、爆破军火库等任务，给鬼子以迎头痛击，上演了一幕幕鲜活真实的、可歌可泣的敌后抗战故事，展示了中华民族不可侮的精神面貌。
夏燃（杨紫 饰）和男友蒋剑南（郭鹏 饰）恋爱多年，感情十分稳定，然而某一日，蒋剑南居然在向夏燃提出分手后下落不明玩起了失踪，莫名被甩一头雾水的夏燃决心一定要找到蒋剑南问清事情的缘由，却在阴差阳错之下结识了蒋剑南的室友金志豪（乔振宇 饰）。夏燃答应假扮金志豪的女友，以抚慰一直对儿子的情感问题耿耿于怀的金志豪的母亲，作为交换条件，金志豪同意帮助夏燃一起寻找蒋剑南的行踪。在此过程中，夏燃和蒋剑南之间渐渐产生了真挚的感情，然而，就在这个节骨眼上，金志豪的前女友忽然现身，使得金志豪陷入了两难之中，目睹此情此景，夏燃默默的选择了退出。
