光盟与影盟战火因“捍世号”暂歇，影盟迅星移为寻和平偶像卷入黑帮火拼，意外获上古星盘后瘫痪。遭觊觎者围攻时被光盟卧底带往光辉地区，发现“捍世号”后得叱风云授武器之法。百万王遇刺后，叱风云遭围攻击退敌人，命迅星移寻上古武器持有者，其失踪老师现身欲揭颠覆秘密。
由人类思想和情感产生的“电子脉冲”被用作人工智能辅助装置“Sapotama”的能量来源。在这一惊人发展的阴影下，出现了可怕的怪物。数码兽是通过消耗电子脉冲进化的生物。天马智郎在与突然从他的Sapotama中出现的月光兽相遇后，经历了一段非同寻常的经历。在与泽城京以及赏金猎人小队“黄金黎明”的其他成员一起生活期间，智郎重新下定了决心。人类和数码兽将创造出怎样的未来？
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