香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
1993年，特技演员烈风（方中信 饰）与女友贺千惠（萱萱 饰）、好友凌克洋（林保怡 饰）前往西安旅游，却意外地在古墓中见到了幼年时的救命恩人步荆红（王菲 饰），他震惊于步荆红20年如一日的容貌并展开了调查。原来步荆红是秦朝时获得长生不老药的舞姬胭脂，孤独千年，只为寻找变 回正常人的秘方，而她不知的是，同样获得了不死之身的秦将军嬴战（单立文 饰）一直都在追寻她的下落。烈风在寻找真相的同时渐渐爱上了步荆红，而荆红却一再压抑，拒绝感情。命运交织，改名为盛世秦的嬴战终于找到了荆红，而他依然不改残暴本性，祸害人间，想尽办法拆散烈风与荆红，并且还想彻底破坏荆红成为普通人的愿望。
吴奇隆饰演潜伏在日伪机关的地下党员。
即将面临大学毕业，四位昔日的同窗好友和他们的家庭，虽然各自面临不同的困扰，但都在追求幸福的旅程上努力前行。林妙妙（赵今麦 饰）即将毕业，面对留学和就业的选择，内心摇摆不定，然而在父母和朋友的支持下，她最终勇敢地向前迈进，收获了丰硕的成果。林大因事业的升级，开设了社区的“乐龄中心”，为社区服务做出了积极贡献。受到林大为（张嘉益 饰）的鼓励，王胜男也投身养老行业，找到了事业的新起点。钱三一（郭俊辰 饰）多年来暗恋着妙妙，尽管母亲对他的感情表达并不看好，但他决心“做回自己”，努力争取家人的理解和支持。江天昊在创业路上历经波折，年少轻狂让他屡次走错路，然而在家人和朋友的支持与鼓励下，他重新点燃希望，继续前行。邓小琪梦想成为杰出的演员，但母亲邓心华却持有不同的看法。尽管面临重重考验，她坚持不懈地追寻自己的艺术之路，最终完成了一次美丽的成长蜕变。
