《命运石之门第二季》主人公冈部伦太郎经历无数的苦难，跨越了尽头悲哀的放弃了挽救“她”的世界线的故事。 失意至底的冈部伦太郎。 被“封印”的“凤凰院凶真”。 担心他的伙伴们。 新登场的角色们。 未被拯救的“她”到底怎么了？ 《STEINS；GATE》中没有登场的新的角色迎来被描绘的“0”的故事。 是的，那里的“她”现在也在——
老街深处的444号小卖部，是跨越古今的神秘驿站。店主陈默接手这家祖传老店后，发现货架上不仅有寻常商品，更藏着能实现心愿、映照人心的奇幻物件。深夜到访的客人形形色色，有追寻真相的亡魂，有背负执念的生者，每桩交易都牵扯出一段尘封的故事。
本季中邪恶的女王曼多拉将孔雀和罗丽抓回仙境，为救出同伴，各位主角将再次闯入仙境。女王控制的仙境更加危险，能否救出同伴我们还将拭目以待。本季中全新角色琪娜将会登场，她拥有神秘娃娃菲灵，并有着独特的战斗技能。她能否击败水王子和封银沙阻止邪恶女王的计划吗？
纳尔逊老师不在的时候，207教室的孩子们就胡闹个不停。他们能骗过校长，却骗不了维奥拉·斯旺普。现在，孩子们迫不及待地盼着纳尔逊老师回来。
艾恩是一名【鉴定师】，一个只有【鉴定】才能完成的弱势职业。同辈们都叫他“垃圾收集者”并虐待他，他自不量力，过着卑微的生活。当艾恩遇见世界树之灵尤里和世界树的智慧守护者乌苏拉时，他的命运发生了巨大的变化。艾恩从尤莉手中得到灵眼，并接受乌苏拉的特别训练以掌握灵眼，实力逐渐增强。为了实现尤莉的愿望“与世界树的其他姐妹见面”，他踏上了旅程。凭借天生的善良和新获得的勇气，他克服了各种挑战。
