丁常旺（郭晋安 饰）自幼就患有智障，智力一直停留在7岁水平，由单身母亲一手带大。阿旺虽然智力不高，但为人正直、十分热心，他和街坊阿凤（宣萱 饰）从小一起长大，青梅竹马；阿凤升学时阿旺甚至将自己的全部积蓄交给阿凤，让她能安心在美国完成学业。阿凤学成归来后进入了本地一家大集团钟氏集团工作，阿旺为了保护阿凤不被坏人欺负，亦进入钟氏集团当了一名信差。钟氏集团的老板（秦沛 饰）其实就是阿旺的亲生父亲，他同父异母的大哥钟子聪（黄宗泽 饰）也在钟氏任经理。阿旺乐于助人、尽职尽责的人生态度感染周围的许多人，只是，他7岁的智力水平能否应付成人世界里的虚伪？
钟泰然（马国明 饰）就读于临床心理治疗专业，毕业后成为了一名心理分析师，对于人性的阴暗和复杂了若指掌。曾秀怡（汤洛雯 饰）是钟泰然的女友，同时亦是一名心理分析师。在一场残暴而又可怕的凶杀案中，凶手卢健强（韦家雄 饰）被绳之于法，判处了终身监禁。
1977年，祸国殃民的十年动乱和四人帮被扫荡汰尽。千疮百孔的国度总算焕发了新的生机，好不容易回复的高考为被耽误了学业和人生的青年们指明了新的道路。靠山屯知青刘思杨（邵峰 饰）和乔慧敏（刘威葳 饰）原打算借此良机共进学业，结为夫妇，谁知却遭到无量知青王富贵（肖光奕 饰）陷害，几经周折，有情人而最终生离死别，天各一方。转眼十年过去，刘以留学博士身份携妻子郝佳丽（刘欣 饰）来到某高校担任系主任，谁知意外重逢已经离婚的惠敏。
《乐在其中之全科门诊》是一部都市喜剧片，讲述了在一个住院部发生的有趣故事。
