家里开蛋糕店的凛太郎，因为高大的体型与凶狠的外表，从他小时候周围的人都对他抱有严重的偏见。某天，帮忙顾店的凛太郎与现场唯一的客人•薰子相遇了。娇小的她面前却有许多盘吃完的蛋糕，薰子一看见他就立刻逃离店里，凛太郎以为是因为自己的外表又吓到别人，不禁感到失落又自责。隔天放学后，他在自己的学校校门口看见薰子在等人……？相邻彼此、校风迥异的两间高中•千鸟与桔梗，分别就读于这两间学校的凛太郎与薰子，交织出酸甜又多彩的青春物语。
为了证明自己不再是“小不点”，海绵宝宝下定决心，要向蟹老板展现他真正的勇气。 他毅然决然追随那位神秘的、纵横四海的幽灵海盗——“飞天魔鬼”，开启了一段惊心动魄、颠覆想象的深海大冒险！这段旅程将带他闯入深海禁区，见证海绵从未触及的神秘世界！
这是一个开心球的世界，在这个世界有着许许多多神奇不可思议的东西。在这里生活着许许多多的开心球们，有善实践的科学家平博士、有知识渊博的鹿教授、还有天真活泼的兔小跳和可爱善良的猬小弟等等。他们一起斗智斗勇、嬉戏打闹，一起坐着平飞船去探讨世界和宇宙中的未知奥秘，小到微观世界的原子大到宇宙大爆发。没有它们做不到的，只有它们想不到：从生物学到物理学，从万有引力再到宇宙混乱论...平博士它们总能通过亲身实践把枯燥乏味的诺贝尔科学知识变得生动并且有趣易懂。
ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。
