三百年后的奇轮星，地球和奇轮星可以通过奇轮火车来往，奇轮射手和奇轮人自由组成搭档进行奇轮对战比赛！但以罗伦为首的黑暗兵团正策划着一个以毁灭奇轮星为目的的阴谋。在《激战奇轮》中第一代的奇轮王烈焰，收到现任奇轮女王凤凰的召唤来到了这里，与李小萨成为搭档参加奇轮大赛。在比赛的过程中，结识了吴官月、陈石武等怀着共同梦想的小朋友。大家从相识、互相了解，到最后共同领悟奇轮魂的真谛，击败毁灭战神，化解奇轮星的危机。在一次次的战斗过程中，小朋友们学会了相互理解、团结友爱、永不言败的精神，明白到只要付出努力，就能得到成功的真正意义。
突然出现在人类面前的神秘飞翔体“灾”。意味着灾厄的此一存在凭借异样的战斗力凌驾于所有的航空战力之上。为对抗他们而开发的，便是对现有机体进行特别调整以实现超水准高机动力，被称为“子体”的兵器。负责操控的则是名为“阿尼玛”的操纵机构。它——竟拥有少女的外表。因“灾”的缘故而失去驾驶员母亲的少年“鸣谷慧”，他遇见了闪耀鲜红光辉的瑞典制战斗机以及驾驶它的阿尼玛“格里芬”。身为人类最终兵器却动作不稳定的格里芬，还有一心向往天空的少年，两人漫长且炙热的故事就此展开。
时值龙腾世纪，大地处于一种神秘而阴森的氛围之中。安卓丝蒂教会是当时万众信仰的归属，为了阻止邪恶自私的血魔法师滥用魔法，危害人间，教会严格禁止人民是用魔法，更组建了圣殿骑士负责追查澧清各种可以分子。在这一过程中，腐败罪恶不断滋长，世界愈加黑暗。十年集会将至，信众从四面八方赶到奥莱桑帝国。在此重要时刻，血魔法师蠢蠢欲动，酝酿着更大的阴谋。拜伦所率领的圣殿骑士展开更为缜密的追查，而屠龙一族的女子卡珊德拉也参与其中。阴谋、罪恶混杂其中，拜伦发现，即使来自身边的人也变得不那么可靠，这群忠心耿耿、勇猛无敌的骑士面临前所未有的挑战…
怪兽世界的侦探多罗邀请原作主角、怪兽猎人麻衣剑野参加武术大会，以选出下一任怪兽首相。然而，麻衣对此毫无兴趣，因为她从未经历过这样的事。麻衣的妹妹光一直在旁观，于是她介入了。于是多罗奉承光，试图让她以麻衣剑野二号的身份参加武术大会。与此同时，在世界的某个角落，怪兽们正密谋改造一个男孩，控制人类世界……
