名叫司马博铭（王志文 饰）的男人是阳光医院响当当的心胸外科大夫，他医术高明，为人正直，是医患可以信赖和托付的对象。某天，阳光医院迎来了几名新成员，他们分别是富家女关姗（刘思言 饰）、在美国深造归来的外科医生韩子航（霍建华 饰）、在学期间成绩突出的巩凡（徐囡楠 饰）、从县级医院送来的代培医生任丘（张浩天 饰），他们全部归于司马医生的麾下学习。这里的病患多种多样，有早产的死刑女囚郝琳、有郁结着诸多秘密乖僻孤独的胸腔积水病人陈佳子……
医生和天使配合解决鬼的问题... 天使是来拯救他们还是来扰乱他们的心？
《秋水长天》是导演黄以功上世纪80年代初期的荧屏作品，曾在播出当年荣获台湾电视“金钟奖”，并奠定了此剧领衔主演者萧芳芳、刘德凯台湾电视文艺片领军人物的地位。20年后，黄以功重拍台湾视坛编剧高手夏美华的这部经典作品，特地将故事的发生地挪到了充满生机与活力的国际大都市上海，因而邀请土生土长的上影青年女编剧、曾以话剧《女人话题》荣膺田汉戏剧文学奖二等奖的王帆执笔改编。新版《秋水长天》仍保留了婉转、凄美的剧情风格和沧海桑田、至死不渝的爱情主题，但视野更加开阔，以传统与现代交替之际的宏大背景，表现了当代人以及两代人价值观念的嬗变和冲突。外商夏天明因为看好上海的发展，将家族企业夏氏乳品总公司迁到上海，并携全家在上海定居，由此，他的一对儿女夏立飞和夏立虹在上海发生了一段刻骨铭心的情感故事。
民国初年，有个小镇以贞节牌坊出名，从进村的道路几步一牌坊，全是历代贞烈妻子的荣耀。名门之女夏梦寒（刘雪华 饰）错嫁纨裤子弟曾靖南，谁料丈夫婚后拈花惹草令温婉的梦寒以泪洗面。曾家义子雨杭（钟镇涛 饰）亲眼看着悲剧发生，心痛梦寒的处境。二人因了解而日久生情，最终强烈的爱意战胜了封建礼教的束缚，当靖南意外丧生后这对有情人开始极力寻找出路，然而这个小镇向来只要求 女子忠贞而不管束男子的花心，雨杭和梦寒被乡亲用棍棒乱打，追赶着度过那九节牌坊，这一幕被梦寒的女儿看到，惊吓过度的她从此不能说话，梦寒和雨杭极力给她一个温暖舒适的家庭，希望她能早日回复正常……
包秀秀（孙翠凤 饰）从小习武，个性活泼开朗，嫁给了秀才文必正，不久之后，可爱的儿子小宝诞生了。之后，文必正告别了家人进京赶考，谁知道这一走就是好几年的了无音信，包秀秀以为文必正已死，只得独自一人靠着卖艺肩负起了抚养小宝的责任。某日，八府巡按下乡视察，让包秀秀没有想到的 是，这八府巡按，竟然正是自己失踪已久的丈夫，原来文必正出发不久就遭遇了险境，所幸得到一位名为如忆（翁虹 饰）的女子搭救，才捡回了一条命，之后更是考中了状元获得了皇帝的赏识封官进爵，现如今，如忆已经成为了他的妻子。虽然文必正一家三口团聚，但包秀秀和如忆之间的关系却如同水火一样一触即发。
