《灵异妙探》第三季继续半搞笑路线，在上季结尾的一声“妈”后，Shawn将在新的一季中面对怎样的案件，处理什么样的父母关系呢？在本季中，一直以为是老爸不对的Shawn或许会了解到一件出乎意料的事实，他能否克服儿时的阴影，父子关系又会向什么方向发展呢？ Shawn的老爸，到底会不会 继续他的“找伴儿”行动？或是与再次出现的前妻再续前情？哦，当然，还请继续跟随Shawn和Gus踏上探案之旅，他出类拔萃的观察能力以及妙语连珠的性格，保准让你继续又骂又爱，虽然Shawn并非通灵师，但他却是位真正的侦探。
1940年，山西问水村民兵队队长窦三喜召集邻村的民兵骨干开会，商讨如何端掉伪军据点薛山寨事宜，但因奸细出卖，所有人壮烈牺牲，缺席会议的妇救会主任翠萍被人怀疑是奸细，为了证明自己的清白，翠萍利用自己的智慧联合了抗日义军首领岳五木拿下了据点，并在八路军连长罗青山的帮助下，不仅证明了自己的清白，还挖出了奸细。随后，罗青山带领翠萍等人重建队伍，发动民众填死水井、炸毁碾磨，巧夺战略物资，配合大部队对铁路线路轨、车站等进行破坏活动，与日军指挥官上衫勇频频对抗，气急败坏的上衫勇发动大规模围剿计划，身边战友们一个个牺牲，翠萍也从一个当初妇救会干事成长为一名合格的八路军战士，最终粉碎了上衫勇一系列的围剿计划，策应大部队反围剿运动。一个月后，翠萍奔赴天津，她带着战友的遗志和爱，投入到了新的战斗任务中。
1941年，国际局势波谲云诡，中国国内更是暗流涌动，一场暴风雨即将席卷古老的华夏大地。适值此时，国际反法西斯同盟特使访华，与国共双方代表召开秘密会议。汪伪反革命政权闻风而动，却最终扑了个空，无功而返。与此同时，某军统情报站遭到破坏，一番酷刑审讯后得知，汪伪行动的情报系从内部泄露。由此，由着重大的嫌疑的汪伪司令部属员李宁玉（刘威葳 饰）、顾小梦（张歆艺 饰）、金生火（宗平 饰）、吴志国（田雨 饰）、白小年（胡海峰 饰）等5人先后被关入神秘恐怖的裘庄。在之后的88小时内，他们面临的不仅是各种无情的刑讯，更有死亡的威胁。谁是泄漏情报的“老鬼”？
